[发明专利]一种生信分析方法、装置、设备及可读存储介质

说明书

本发明提供了生信分析方法、装置、设备及可读存储介质，应用于生物信息处理技术领域，在获取生信分析文件之后，基于生信分析文件，构建生信分析流程，不再需要测序公司构建生信分析流程，同时展示生信分析流程的配置页面，以使用户在生信分析流程的配置页面中灵活配置待分析的基因测试数据以及分析参数，基于分析参数，执行生信分析流程，对待分析的基因测试数据进行分析，得到分析结果，保证了基因测试数据的安全性，页面操作简单与理解，节省了大量的时间和精力。

技术领域

本发明属于生物信息处理技术领域，尤其涉及一种生信分析方法、装置、设备及可读存储介质

背景技术

生信分析是利用计算机对基因测试数据进行生物信息分析，挖掘新的生命科学问题。随着精准医疗的发展，对于基因测序数据的管控将会越来越规范化。

现有技术中，对于基因测试数据进行生信分析的生信分析流程往往由测序公司中生信分析团队进行搭建，并部署于服务器或集群上，操作和运行均在linux系统上进行，最终得到的是测序公司构建的生信分析流程中某些固定参数下得到的结果。

但是，测序公司构建的生信分析流程中的参数需要多次调整才能得到与基因测试数据相关的生信分析结果，耗费了大量的精力和时间，并且基因测试数据流失于测序公司，不利于基因测试数据的安全性。

发明内容

鉴于上述问题，本申请提出了一种生信分析方法、装置、设备及可读存储介质，为了节省精力和时间，并保证基因测试数据的安全性，具体方案如下：

一种生信分析方法，包括：

获取生信分析文件；

基于所述生信分析文件，构建生信分析流程，并展示所述生信分析流程的配置页面，所述生信分析流程的配置页面用于配置待分析的基因测试数据以及分析参数；

基于所述分析参数，执行所述生信分析流程，对所述待分析的基因测试数据进行分析，得到分析结果。

可选的，在基于所述分析参数，执行所述生信分析流程，对所述待分析的基因测试数据进行分析，得到分析结果之后，还包括：

若分析成功，对所述生信分析流程进行共享；

若分析失败，对所述生信分析流程进行私有化处理。

可选的，所述生信分析文件，包括：流程文件、脚本文件、环境文件和数据库文件。

可选的，所述流程文件包括第一配置信息、第二配置信息和第三配置信息，所述第一配置信息为所述生信分析流程中所使用的功能模块的名称、版本和配置文件名称、所述第二配置信息用于指示所述生信分析流程是否需要样本信息表信息，所述第三配置信息用于指示所述生信分析流程是否关联项目信息；

所述脚本文件包括所述生信分析流程中所使用的功能模块的配置文件，所述配置文件包括环境信息、数据库信息、所述功能模块的参数信息和执行所述功能模块的命令行信息；

所述环境文件包括所述生信分析流程所需的镜像文件；

所述数据库文件包括所述生信分析流程所需的数据库信息。

可选的，所述基于所述生信分析文件，构建生信分析流程，包括：

对所述生信分析文件进行解析和校验；

若所述生信分析文件解析和校验成功，将解析和校验后的生信分析文件构建为生信分析流程。

一种生信分析装置，包括：

获取单元，用于获取生信分析文件；

构建单元，用于基于所述生信分析文件，构建生信分析流程，并展示所述生信分析流程的配置页面，所述生信分析流程的配置页面用于配置待分析的基因测试数据以及分析参数；