[发明专利]Oligo (dT) beads试剂在富集和纯化双链DNA Poly A中的应用在审
申请号: | 202310266696.1 | 申请日: | 2023-03-20 |
公开(公告)号: | CN116574722A | 公开(公告)日: | 2023-08-11 |
发明(设计)人: | 陈小梅;张伟;赵国凤;李娇 | 申请(专利权)人: | 上海甲贝医药科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 上海三方专利事务所(普通合伙) 31127 | 代理人: | 钱品兴 |
地址: | 201108 上海市闵行区景联路25*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | oligo dt beads 试剂 富集 纯化 dna poly 中的 应用 | ||
本发明提供了一种Oligo(dT)beads试剂在富集和纯化双链DNAPoly A中的应用方法,该方法包括:步骤S1,双链DNA Poly A的富集纯化:用与Oligo(dT)beads配套的Binding Buffer清洗Oligo(dT)beads,收集Oligo(dT)beads,加入Binding Buffer,加入含有双链DNA Poly A的溶液混合均匀并反应一段时间,收集Oligo(dT)beads;步骤S2,双链DNA Poly A的洗脱:向步骤S1最终收集到的Oligo(dT)beads中加入洗脱液,洗脱一段时间后,收集上清液,该上清液即含有富集纯化到的双链DNA Poly A。其中,Oligo(dT)beads为Oligo(dT)偶联到琼脂糖beads表面或Oligo(dT)偶联到磁珠表面。本发明采用Oligo(dT)beads与双链DNA Poly A混合孵育,实现从复杂体系中富集和纯化双链DNA Poly A的目的。本发明提供的应用方法,操作简便,富集纯化耗时短,便于通量操作。
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及Oligo(dT)beads试剂在富集和纯化双链DNAPoly A中的应用。
背景技术
Oligo(dT)磁珠为磁珠表面共价偶联Oligo(dT)。磁珠尺寸均匀,在溶液中可灵活移动,这使得微珠捕获表面能够在mRNA捕获阶段与整个总RNA样品快速连续地相互作用,进而Oligo(dT)与真核生物mRNA尾部的Poly A互补配对,可用于高效地从任何总真核生物RNA或直接从动植物组织或细胞裂解物中快速分离出完整、高纯度的mRNA。
Oligo(dT)磁珠的应用主要是利用Oligo(dT)磁珠与含有Poly A的mRNA结合达到从复杂总mRNA中富集mRNA的目的(Genet Mol Biol.2023 Jan 6;45(4):e20210379;BiolProced Online.2022 Dec 27;24(1):26)。Michael Beverly(Anal Bioanal Chem.2018Feb;410(6):1667-1677)利用RNase T1处理体外转录合成的mRNA,酶切得到游离的Poly AmRNA片段,再利用Oligo(dT)磁珠从溶液中富集Poly A mRNA片段,进而利用质谱手段检测出Poly A mRNA片段中A的数量。
目前市售的Oligo(dT)磁珠,如Thermo公司的DynabeadsTM mRNA纯化试剂盒(用于从总RNA制备液中纯化mRNA),货号61006;NEB公司的Oligo d(T)25Magnetic Beads,货号S1419S;国产BEAVER公司的Oligo dT磁珠,货号70430-1。这些磁珠均用来富集和纯化单链的富含Poly A的mRNA。
发明内容
双链DNA Poly A,即Poly A片段为DNA,且该DNA片段含有双链,其中一条链富含Poly A,另外一条链为与Poly A互补的Poly T片段。本发明将Oligo(dT)beads用于富集和纯化双链DNA Poly A,提供了一种Oligo(dT)beads试剂在富集和纯化双链DNA Poly A中的应用方法。
本发明的具体技术方案如下:
本发明提供的Oligo(dT)beads试剂在富集和纯化双链DNA Poly A中的应用方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤S1,双链DNA Poly A的富集纯化:用与Oligo(dT)beads配套的Binding Buffer清洗Oligo(dT)beads,收集Oligo(dT)beads,加入Binding Buffer,加入含有双链DNA Poly A的溶液混合均匀并反应一段时间,收集Oligo(dT)beads;步骤S2,双链DNA Poly A的洗脱:向步骤S1最终收集到的Oligo(dT)beads中加入洗脱液,洗脱一段时间后,收集上清液,该上清液即含有富集纯化到的双链DNA Poly A。
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