[发明专利]一种面向MRI影像的帕金森病智能诊断分析方法在审
申请号: | 202211270704.1 | 申请日: | 2022-10-15 |
公开(公告)号: | CN116072267A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
发明(设计)人: | 聂烜;高和瑜;柴博松;黄仁念 | 申请(专利权)人: | 西北工业大学 |
主分类号: | G16H30/20 | 分类号: | G16H30/20;G16H50/20;G06T7/00;G06T7/11 |
代理公司: | 西安凯多思知识产权代理事务所(普通合伙) 61290 | 代理人: | 刘涛 |
地址: | 71007*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 面向 mri 影像 帕金森病 智能 诊断 分析 方法 | ||
1.一种面向MRI影像的帕金森病智能诊断分析方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤1:获取医学影像数据的体素、空间间距、窗宽窗位信息,并进行可视化展示;
步骤1-1:从DICOM格式医学影像中读入MRI影像数据和DaT数据,对两种数据采用不同的特征提取方法提取特征;
步骤1-2:使用FSL-bet工具对MRI影像数据进行颅骨剥离预处理;
步骤1-3:获取医学影像的体素、空间间距、三维图像大小信息;
步骤1-4:展示读取的医学影像数据;
步骤2:病灶区域检测模块,使用YOLO v5模型对病灶区域进行检测,输出患病风险分数和病灶区域,并进行可视化展示;
步骤2-1:将MRI数据和DaT数据转换为PNG格式图像,对脑部MRI影像的红核黑质区域进行标注,将标注完成的脑部MRI影像数据划分为训练集,测试集和验证集;
步骤2-2:使用基于改进后的YOLOv5网络的定位模型完成脑部MRI影像红核黑质区域的定位;
所述基于改进后的YOLOv5网络的定位模型,包括输入端、改进后的Backbone模块、Neck模块、YOLO head模块与定位模块;所述输入端是Mosaic数据增强算法;所述改进后的Backbone模块包含Focus层、两组CBL和CSP_1、一组CBL和SPP;所述Neck模块包含FPN+PAN结构与两组CBL+CSP2_X;所述YOLO head模块包含两个尺度的检测头;所述定位模块包含非极大值抑制、IOU阈值判定、使用DIOU损失函数评价位置损失、使用BCE损失函数评价真实框和预测框的物体类别置信度损失;所述真实框是指脑部MRI影像红核黑质区域对应的最小外接矩形;
步骤2-3:把测试集输入到基于改进后的YOLOv5网络的定位模型中,完成对MRI影像中红核黑质区域定位,提取定位结果中预测框的相对位置信息;所述预测框是指由YOLOv5网络模型生成的矩形边框,用于将定位出的红核黑质区域在MRI影像中进行框选;
基于一维卷积神经网络的分类模型获取到预测框的相对位置信息,经过坐标转换与区域截取模块得到脑部MRI影像预测框内的红核黑质区域,定位了黑质区域并显示它是否健康;一维卷积神经网络模型将获取到的平均光谱值经一维卷积降维后,最终对黑质区域进行检测,并将mAP值作为网络预测患病的分数的一个评估指标,判断是否健康;
步骤2-4:使用基于YOLOV5的检测网络模型完成DaT数据红核黑质区域的定位;对红核黑质区域进行检测,并显示患病的分数,识别是否健康;
所述基于YOLOV5的检测网络模型包括主干backbone、Neck和输出模块output三个部分;所述主干backbone包括BottleneckCSP模块和Focus模块;所述BottleneckCSP模块用于增强整个卷积神经网络学习性能;所述Focus模块用于对图片进行切片操作,将输入通道扩充为原来的4倍,并经过一次卷积得到下采样特征图;所述Neck中采用了FPN与PAN结合的结构,将FPN层与自底向上的特征金字塔进行结合,将所提取的语义特征与位置特征进行融合,同时将主干层与检测层进行特征融合;所述输出模块output对图像特征进行预测,输出一个具有目标对象的类别概率、对象得分和该对象边界框的位置的向量;
步骤3:病灶区域分割模块,细化DaT图像特征,使用U-Net网络对纹状体区域进行分割,将特征区域分为右侧黑质定位到病变区域,并进行可视化展示;
步骤3-1:基于DaT数据,模型分别输出左右纹状体分割和识别结果;将DaT数据YOLOv5和U-Net两次预测结果结合起来进行判断;
步骤3-2:使用EfficientNetB4作为主干的UNET的预测结果;分割图有5个不同的类别:背景、健康的左侧纹状体、健康的右侧纹状体、不健康的左侧纹状体和不健康的右侧纹状体。
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