[发明专利]特异性识别胎盘特异性蛋白1的核酸适配体及其用途在审
申请号: | 202210917487.4 | 申请日: | 2022-08-01 |
公开(公告)号: | CN116004633A | 公开(公告)日: | 2023-04-25 |
发明(设计)人: | 杜通;吕祁峰;赵栋;匡延平 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学医学院附属第九人民医院 |
主分类号: | C12N15/115 | 分类号: | C12N15/115;G01N33/68;G01N33/574;G01N33/543;A61K47/54;A61P35/00 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 聂月美;许亦琳 |
地址: | 200011 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异性 识别 胎盘 蛋白 核酸 适配体 及其 用途 | ||
本发明属于生物技术领域,公开了特异性识别胎盘特异性蛋白1的核酸适配体及其用途。所述核酸适配体的核苷酸序列包括SEQ ID No.1‑57所示序列中的任一项。本发明采用X‑aptamer筛选技术,结合高通量测序技术及生物信息学分析,降低筛选的轮次并获得候选核酸适配体,通过进一步分析其亲和性和特异性,得到特异性识别胎盘特异性蛋白1的核酸适配体。本发明的核酸适配体具有亲和性及特异性高、稳定性好、合成方便、易标记功能基团等特点,可用于胎盘特异性蛋白1的检测或结合、胎盘特异性蛋白1相关疾病的诊断、预后等产品的制备。
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及特异性识别胎盘特异性蛋白1的核酸适配体及其用途。
背景技术
胎盘特异性蛋白1(Placenta Specific Protein 1,PLACl)的基因定位于染色体Xq26.3,全长约92641bp,含有3个外显子,第3外显子为编码区,编码1.7kb的mRNA。PLACl蛋白总共含有212氨基酸残基,其中第5-22个氨基酸为跨膜螺旋结构区域,而第23-212个氨基酸为细胞外区域。目前研究显示,在正常女性人类的组织中,PLAC1特异性表达于胎盘中,定位于滋养层细胞胞膜上。此外,PLACl蛋白也表达于男性前列腺组织、多种人体癌症细胞(诸如绒毛膜癌、乳腺癌、肺癌、肝癌、结肠癌、胃癌、卵巢癌、前列腺癌、胰腺癌、宫颈癌等)中(Nejadmoghaddam,Mohammad-Reza,Zarnani,Amir-Hassan,Ghahremanzadeh,Ramin,等.Placenta-specific1(PLAC1)is a potential target for antibody-drug conjugate-based prostate cancer immunotherapy[J].Scientific Reports,7(1):13373.)。
人的PLAC1与小鼠的Plac1在基因碱基和蛋白质氨基酸层面分别约有75%和60%的序列相同。
目前,针对PLAC1蛋白的高亲和力及高特异性分子识别只有PLAC1蛋白抗体,国内外尚无关于针对PLACl/Plac1蛋白的核酸适配体的研究报道。
发明内容
鉴于以上所述现有技术的缺点,本发明的目的在于提供特异性识别胎盘特异性蛋白1的核酸适配体及其用途,进而解决现有技术中的问题。
本发明的第一方面保护特异性识别胎盘特异性蛋白1的核酸适配体,所述核酸适配体包括1)-5)中的至少一项:
1)核苷酸序列包括SEQ ID No.1-57所示序列中的任一项的单链DNA;
2)与1)限定的核苷酸序列具有75%以上同一性,且特异性识别胎盘特异性蛋白1的单链DNA;
3)将1)限定的核苷酸序列删除或增加一个或几个核苷酸,且特异性识别胎盘特异性蛋白1的单链DNA;
4)由1)~3)任一项限定的核苷酸转录且特异性识别胎盘特异性蛋白1的单链RNA;
5)在严格条件下与1)或2)或3)限定的核苷酸序列杂交,且特异性识别胎盘特异性蛋白1的任一单链DNA或单链RNA。
根据本发明的技术方案,所述核酸适配体的核苷酸序列如SEQ ID No.3或如SEQID No.9所示序列。
根据本发明的技术方案,所述2)中的核苷酸序列具体指:如SEQ ID No.1-57其中之一所示的核苷酸序列经过取代一个或多个(具体可以是1-10个、1-5个、或1-3个)碱基而得到的。所述22)中的核苷酸序列可与SEQ ID No.1-57其中之一具有80%、85%、90%、93%、95%、97%或99%以上的同源性。
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