[发明专利]病原真菌的代谢网络构建方法、装置、设备及存储介质

权利要求书

1.一种病原真菌的代谢网络构建方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

基于目标真菌的代谢反应，构建初始代谢网络模型，并基于所述初始代谢网络模型，构建化学计量矩阵；

基于至少一个预设约束方程，对所述化学计量矩阵进行约束，获得至少一个容许解空间；

基于预设优化函数和各容许解空间，确定各代谢物的最优通量分布，并基于所述最优通量分布，重建目标代谢网络。

2.根据权利要求1所述的病原真菌的代谢网络构建方法，其特征在于，所述基于所述初始代谢网络模型，构建化学计量矩阵，包括：

基于所述目标真菌的代谢反应，确定化合物和参与所述代谢反应的代谢物的化学计量系数；

基于所述化合物和所述化学计量系数，构建所述化学计量矩阵。

3.根据权利要求1所述的病原真菌的代谢网络构建方法，其特征在于，所述基于至少一个预设约束方程，对所述化学计量矩阵进行约束，获得至少一个容许解空间之前，还包括：

基于所述目标代谢网络模型中的至少一个通量，获得至少一个目标向量；其中所述目标向量与所述通量一一对应；

基于所述目标向量和所述化学计量矩阵，生成所述预设约束方程。

4.根据权利要求1所述的病原真菌的代谢网络构建方法，其特征在于，所述基于至少一个预设约束方程，对所述化学计量矩阵进行约束，获得至少一个容许解空间之前，还包括：

基于预设约束条件，约束所述代谢反应中的代谢物通量，获得所述预设约束方程；其中所述预设约束条件包括物理-化学约束和环境条件约束。

5.根据权利要求4所述的病原真菌的代谢网络构建方法，其特征在于，所述基于预设约束条件，约束所述代谢反应中的代谢物通量，获得所述预设约束方程，包括：

基于所述物理-化学约束，确定所述代谢反应中的代谢漏洞；

基于所述代谢漏洞，确定修补代谢反应，并基于所述修补代谢反应中的所述代谢物通量，获得所述预设约束方程。

6.根据权利要求4所述的病原真菌的代谢网络构建方法，其特征在于，所述基于预设约束条件，约束所述代谢反应中的代谢物通量，获得所述预设约束方程，还包括：

基于所述环境条件约束，调整所述代谢反应方向，获得限制通量，并基于所述限制通量，获得所述约束约束方程。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的病原真菌的代谢网络构建方法，其特征在于，所述基于所述最优通量分布，重建目标代谢网络之后，还包括：

基于预设鉴定条件，对所述病目标代谢网络进行评估，获得评估结果；

基于所述评估结果，对所述目标代谢网络进行修正，获得修正代谢网络，作为所述目标代谢网络。

8.一种病原真菌的代谢网络构建装置，其特征在于，所述病原真菌的代谢网络构建装置包括：

化学计量矩阵构建模块，用于基于目标真菌的代谢反应，构建初始代谢网络模型，并基于所述初始代谢网络模型，构建化学计量矩阵；

矩阵求解模块，用于基于至少一个预设约束方程，对所述化学计量矩阵进行约束，获得至少一个容许解空间；

目标代谢网络重建模块，用于基于预设优化函数和各容许解空间，确定各代谢物的最优通量分布，并基于所述最优通量分布，重建目标代谢网络。

9.一种病原真菌的代谢网络构建设备，其特征在于，所述病原真菌的代谢网络构建设备包括处理器、存储器、以及存储在所述存储器上并可被所述处理器执行的计算机程序，其中所述计算机程序被所述处理器执行时，实现如权利要求1至7中任一项所述的病原真菌的代谢网络构建方法的步骤。

10.一种计算机可读存储介质，其特征在于，所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序，其中所述计算机程序被处理器执行时，实现如权利要求1至7中任一项所述的病原真菌的代谢网络构建方法的步骤。