[发明专利]一个水稻籼粳杂种花粉育性基因座及其应用

权利要求书

1.一种水稻籼粳杂种花粉育性基因座，其特征在于：名称为qHMS12，位于12号染色体末端，精细定位于分子标记PSM623和IND48之间，包含两个育性相关基因ORF3和ORF4；

基因ORF3的核酸序列如SEQ ID NO:1所示；

基因ORF4的核酸序列如SEQ ID NO:2所示。

2.基因ORF3所编码的蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。

3.基因ORF4所编码的蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。

4.权利要求1所述的水稻籼粳杂种花粉育性基因座、权利要求2所述的基因ORF3所编码的蛋白质或权利要求3所述的基因ORF4所编码的蛋白质在杂交育种中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于包括如下步骤：通过破坏基因ORF3的功能或敲除基因ORF3，提高水稻杂种花粉育性；或者转入基因ORF4，提高水稻杂种花粉育性。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于：

所述的通过破坏基因ORF3的功能或敲除基因ORF3的方法为基因编辑。

7.一种广亲和水稻材料的制备方法，其特征在于包括如下步骤：

(1)将含有基因ORF3的水稻材料中的基因ORF3的功能破坏或敲除基因ORF3，得到改造后的材料；将改造后的材料自交，在后代中筛选出不携带转基因载体且基因ORF3发生突变的纯合突变植株，获得广亲和水稻材料；

或是，

(2)通过对水稻品种的基因ORF3进行分析，获得基因ORF3发生自然变异导致不具备基因ORF3功能的水稻品种，即得广亲和水稻材料。

8.根据权利要求7所述的广亲和水稻材料的制备方法，其特征在于：

步骤(1)中所述的基因ORF3发生突变的核酸序列如SEQ ID NO:5所示；

步骤(2)中所述的基因ORF3发生自然变异导致不具备基因ORF3功能的水稻品种中的ORF3的ORF序列如SEQ ID NO:6所示，蛋白编码序列如SEQ ID NO:7所示。

9.一种通过鉴别水稻材料中是否存在ORF3而初步鉴别材料籼粳性的分子标记I3-1，其特征在于：引物为序列如SEQ ID NO:8所示的I3-1F和序列如SEQ ID NO:9所示的I3-1R。

10.权利要求9所述的分子标记I3-1在水稻杂交育种中的应用，其特征在于：所述的分子标记I3-1用于杂交后代检测，或是用于分子标记辅助选择育种。