[发明专利]从假单胞菌PF-11培养物制备的防污组合物

说明书

本发明涉及一种制备细菌上清液的方法，包括培养假单胞菌环境菌株PF‑11细胞；和回收该上清液。本发明还涉及一种减少表面上生物膜的量，减少表面上至少一种生物体的粘附，减少表面上小面积污染和大面积污染的方法，包括使该表面与假单胞菌菌株PF‑11的上清液、上清液级分、改良的上清液或改良的上清液级分；或包括假单胞菌菌株PF‑11的上清液、上清液级分、改良的上清液或改良的上清液级分，和一种或多种可接受的载体的组合物接触。本发明还涉及杀死或减少真菌或细菌细胞生长，或杀死或抑制昆虫或海洋桡足类发展的方法，包括使该真菌、细菌、昆虫或海洋桡足类与假单胞菌菌株PF‑11培养物的上清液、上清液级分、改良的上清液或改良的上清液级分；或包括假单胞菌菌株PF‑11培养物的上清液、上清液级分、改良的上清液或改良的上清液级分，和一种或多种可接受的载体的组合物接触。本发明还涉及假单胞菌菌株PF‑11的基本上纯的培养物。本发明还涉及富集假单胞菌菌株PF‑11的培养物。本发明还涉及一种鉴别细菌是否能够产生一种或多种能够消化高分子量底物的胞外蛋白酶的方法。

贯穿本申请，引用了各种各样的出版物，包括括号中引用的。括号中引用的出版物的完整的引文信息可找到列在说明书结尾权利要求书之前。全部引用的出版物的公开内容以其全部特此援引并入本申请以便更充分地描述本发明所属的技术状态。

背景技术

抗菌剂耐药性(Antimicrobial Resistance)

由于越来越多的细菌对抗菌剂的耐药性，以后十年治疗和预防细菌感染是世界范围内的主要的健康挑战(Kaplan 2004)。由于多药耐药性细菌，每年仅欧盟就有超过25000个患者死于感染，造成15亿的社会总的直接成本(ECDC/EMA joint technical report2009)。但是用于治疗人类病原体的抗生素也用在动物中治疗疾病，促进生长和提高饲料转化效率(FAO/OIE/WHO 2003)。结果，来自城市和农业来源的抗生素在土壤和水环境中持续存在，存在导致选择耐药性细菌的强大压力。于是在动物饲养厂和屠宰场中，在土壤和废水中，在城市和农业污水水域中发现了存在具有抗菌剂耐药性的细菌。已经显示大多数这些耐药性细菌将抗性基因传递给人类病原体(Martínez 2013)。因此，抗生素的连续使用和滥用强有力地促进了选择环境抗性菌株(environmental resistant strains)，这能够将AMR机制传递给病原体菌株，并且导致断裂点(其中治疗用途中引入的任何新抗菌素将在短期内激发允许细菌对它的使用变得有抗性的机制的选择)。

新的可用抗生素流已经下降，在1990年代和这个世纪的第一个十年中更少的数量被批准(Boucher et al.2009)。因此，由于AMR细菌导致的感染负担和用以解决这个问题的新的抗生素的研发之间存在差距。这本质上归因于难以研发新的有效的抗生素，很容易被细菌克服，落实新的抗生素使用的监管困难和对制药工业来说抗生素的利润减少的事实(Livermore 2011；Payne etal.2007)。因此，研究工作应集中在研发具有原始的作用模式的新抗菌策略，这是有效的并且将不会培养AMR机制。

生物污染(Biofouling)

生物体能够粘附在大多数多元化环境的、自然的和人工合成的表面上并且在这些表面上生长。生物污染包括当暴露于水时由形成细菌或微藻粘附的条件膜的吸收的有机材料的积累引发的多层表面定居的自然过程，该自然过程导致生物膜形成(Abarzua et al.，Olsen et al.)。

需要用于减少抗菌剂耐药性和生物污染的新颖的方法和组合物。

杀真菌剂(Fungicides)

由微生物体产生的抗真菌化合物(比如抗生素)的利用已经被高度利用于研发新的活性化合物，强烈集中在药用化合物。

几种细菌已经被鉴定为本质上产生各种抗真菌的化合物和抗生物，包括酶、铁载体和多种多样的分子，比如氰化氢或乙烯。