[发明专利]一种用于预测疾病的去除多站点功能磁共振成像异质性方法有效
申请号: | 202210515422.7 | 申请日: | 2022-05-12 |
公开(公告)号: | CN114882992B | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
发明(设计)人: | 胡文心;林妍妤;蔡建华 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | G16H50/20 | 分类号: | G16H50/20;G16H50/30;G06N3/0464;G06N3/08 |
代理公司: | 上海蓝迪专利商标事务所(普通合伙) 31215 | 代理人: | 徐筱梅;张翔 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 预测 疾病 去除 站点 功能 磁共振 成像 异质性 方法 | ||
1.一种用于预测疾病的去除多站点功能磁共振成像异质性方法,其特征在于采用解耦表示学习的约束方法,将原始fMRI数据解耦表示成站点不变和站点特定嵌入,然后使用站点特定嵌入构造人口图的边,站点不变嵌入表示结点,使用基于JK-Net设计的人口图卷积神经网络进行疾病的预测,具体实施包括以下步骤:
步骤一:数据处理与特征工程
1-1:获取患病人群与正常人群的多站点静息态fMRI数据,应用HO脑图谱提取Fisher变换后的脑网络功能连接矩阵;
1-2:获取包括站点、性别和年龄信息的表型数据集,使用脑网络功能连接矩阵的上三角部分构建特征向量,应用递归式特征消除选取前2000维表示脑网络特征;
步骤二:网络设计模块
2-1:将脑网络特征通过双头编码器解耦表示为站点不变和站点特定嵌入;
2-2:利用站点特定嵌入和表型信息构造人口图的边,使用站点不变嵌入表示结点即被试,通过四层图卷积网络与JK-Net在所构造的人口图上进行结点特征的传播与变换,构建结合JK-Net的四层图卷积神经网络;
步骤三:网络训练与输出模块
采用正则约束对构建的人口图卷积神经网络进行训练,通过图卷积神经网络特征变换,得到二维向量中概率更大的类别作为人口图中未标注的结点类别,将完成网络训练的四层图卷积神经网络进行疾病的预测;
所述步骤二的网络设计模块具体包括:
1)双头编码器、站点分类器和解码器均为MLP;
2)人口图的构造利用站点特定嵌入和归一化的表型特征,表型特征通过MLP映射到高维表示后,将得到的高维表示与站点特定嵌入拼接得到计算边权重的输入,最后计算两两结点输入的cosine相似性作为边的权重;
3)人口图卷积神经网络传播与变换结点的站点不变嵌入,包含了四层图卷积网络,并应用JK-Net以缓解过平滑,将每一层的输出拼接起来,通过一层MLP进行诊断。
2.根据权利要求1所述用于预测疾病的去除多站点功能磁共振成像异质性方法,其特征在于所述步骤一的数据处理与特征工程具体包括:
1)对于多站点静息态fMRI数据,采用nilearn库获取基于HO脑图谱的脑网络功能连接矩阵,将矩阵的上三角部分逐行相连构建脑网络的特征向量;
2)对于当前脑网络的特征向量,应用递归式特征消除方法,即基于外部估计器为每一特征赋予的权重,递归选取更重要的2000维特征作为原始fMRI特征。
3.根据权利要求1所述用于预测疾病的去除多站点功能磁共振成像异质性方法,其特征在于所述步骤三的网络训练与输出模块具体包括:
1)采用基于对抗的域自适应方法提取站点不变信息,将解耦所得站点不变嵌入通过梯度反转层,并由站点分类器识别该嵌入来自哪个站点,由此产生站点分类损失;
2)将站点不变和站点特定嵌入拼接并送入解码器,解码fMRI特征与原始fMRI特征间的距离构成重构损失,以保证解耦的完整性;
3)使用欧几里得范数构建站点特定嵌入的稀疏化约束;
4)基于人口图卷积的疾病预测损失;
5)通过三个超参数对损失求和建立最终的损失函数,并应用梯度下降法优化模型参数。
4.根据权利要求1所述用于预测疾病的去除多站点功能磁共振成像异质性方法,其特征在于所述正则约束包含基于梯度反转层的站点分类损失、重构损失、基于人口图卷积的疾病预测损失或站点特定嵌入稀疏化约束。
5.根据权利要求1所述用于预测疾病的去除多站点功能磁共振成像异质性方法,其特征在于所述人口图中未标注的结点类别采用大量的无标注fMRI数据和少量的有标注fMRI数据。
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