[发明专利]基于补体相关基因的肉瘤患者预后预测模型和试剂盒中的应用

说明书

本发明提供C1S表达和C1QBP表达在构建用于肉瘤患者预后预测模型中的应用及检测C1S表达和C1QBP表达在制备用于肉瘤患者预后预测试剂盒中的应用。本发明提供了一种基于肿瘤标本的C1S、C1QBP表达的预测肉瘤患者预后的方法，在肉瘤患者的预后分层中具有较大的帮助。该模型在TCGA的肉瘤公共队列中对1,3,5年预后预测的AUC达到0.714、0.665、0.678，在TARGET‑OS公共队列中对1,3,5年预后预测的AUC达到0.719、0.648、0.590，在GSE63157公共队列中对1,3,5年预后预测的AUC达到0.730、0.673、0.630，具有较为优越的预测性能。

技术领域

本发明涉及生物医学领域，具体涉及基于补体相关基因的肉瘤患者预后预测模型和试剂盒中的应用。

背景技术

肉瘤是一组罕见肿瘤，其发病率约占恶性肿瘤的1％。根据组织来源的不同，肉瘤可分为骨肉瘤和软组织肉瘤，它们包括了100多种不同的组织学亚型。肉瘤内部差异较大，且总体对包括免疫治疗在内的全身性的治疗不敏感，因此对患者的临床管理较为困难。为提升医疗实践中肉瘤的诊疗行为，根据不同的患者预后更好的进行差异化管理，亟待开发一种对肉瘤患者进行预后分层和免疫治疗预测的方法。

补体是先天免疫系统的重要组成成分，具有抵抗外来病原体并维持免疫稳态的作用。补体系统可介导对细胞的杀伤作用。但随着相关研究的深入，越来越多研究证实了补体系统在肿瘤进展中有着促进作用。补体系统的激活可以导致肿瘤微环境的慢性炎症，使得肿瘤发生免疫逃逸。在先前的研究中(Nature Cancer 2021Feb；2(2):218-232.)，补体的凝集素途径已被证明能够促进肉瘤的免疫抑制；且对TCGA的肉瘤队列分析(Nature ReviewCancer 2019 Dec；19(12):698-715)也得出结论，证明了补体基因表达与患者预后的显著相关性。因此，用补体相关基因构建患者的预后模型具有原理上的可行性。

发明内容

本发明的目的在于提供C1S表达和C1QBP表达在构建用于肉瘤患者预后预测模型中的应用及检测C1S表达和C1QBP表达在制备用于肉瘤患者预后预测试剂盒中的应用。

根据本发明的一实施方式，将C1S表达水平和C1QBP表达水平代入模型公式，计算每个样本的风险评分；以及根据所述风险评分对肉瘤患者预后进行预测；其中，所述模型公式为risk score＝(0.568945965×C1QBP表达水平)+(-0.338438143×C1S表达水平)。

根据本发明的另一实施方式，所述C1S表达为所述C1S的RNA表达或蛋白表达；所述C1QBP表达为所述C1QBP的RNA表达或蛋白表达。

本发明提供了一种基于肿瘤标本的C1S、C1QBP表达的预测肉瘤患者预后的方法，在肉瘤患者的预后分层中具有较大的帮助。该模型在TCGA的肉瘤公共队列中对1,3,5年预后预测的AUC达到0.714、0.665、0.678，在TARGET-OS公共队列中对1,3,5年预后预测的AUC达到0.719、0.648、0.590，在GSE63157公共队列中对1,3,5年预后预测的AUC达到0.730、0.673、0.630，具有较为优越的预测性能。

附图说明

图1是模型在TCGA肉瘤队列的training组中的性能。

图2是模型在TCGA肉瘤队列的test组中的性能。

图3是模型在TCGA肉瘤队列中的性能。

图4是TCGA肉瘤队列中high risk组和low risk组的免疫检查点基因表达及ESTIMATE相关指标评分。

图5是模型在TARGET-OS队列中的性能。

图6是模型在GSE63157队列中的性能。

图7是模型在独立队列中的性能。