[发明专利]一种单细胞ATAC-seq数据分析系统及方法在审

专利信息
申请号: 202210144940.2 申请日: 2022-02-17
公开(公告)号: CN114496079A 公开(公告)日: 2022-05-13
发明(设计)人: 张剑;吴德沛;官宏宇 申请(专利权)人: 张剑
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 215008 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 单细胞 atac seq 数据 分析 系统 方法
【权利要求书】:

1.一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,包括:

微流控芯片(1),所述微流控芯片(1)的输出端连接有基因抽取模块(5),且基因抽取模块(5)的输出端依次连接有DNA切割模块(6)、Tn5转座酶提取模块(7)、引物调控模块(8)和PCR扩增模块(9),所述PCR扩增模块(9)的输出端连接有DNA测序模块(10),且DNA测序模块(10)的输出端连接有DNA序列存储模块(11),所述DNA序列存储模块(11)的输出端连接有质量控制模块(14);

中转存储模块(17),其连接在所述DNA切割模块(6)的输出端,所述中转存储模块(17)的输出端连接有微流控分析模块(15),且微流控分析模块(15)的输出端连接有序列比对模块(16),所述序列比对模块(16)的输入端连接有peak注释模块(18);

数据汇总模块(21),其连接在所述微流控分析模块(15)的输出端;

基因采集模块(2),其连接在所述微流控芯片(1)的输入端,所述微流控芯片(1)的输出端分别连接有初始存储模块(3)和基因复制模块(4)。

2.根据权利要求1所述的一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,所述数据汇总模块(21)还设有:

数据处理模块(22),其连接在所述数据汇总模块(21)的输出端,所述数据处理模块(22)的输出端分别连接有数据对比模块(23)和数据转化模块(24),且数据转化模块(24)的输出端连接有图谱绘制模块(25)。

3.根据权利要求2所述的一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,所述数据处理模块(22)、数据转化模块(24)和图谱绘制模块(25)依次通过导线电性串联,且数据汇总模块(21)与数据处理模块(22)通过导线电性串联,所述数据处理模块(22)与数据对比模块(23)通过导线电性串联。

4.根据权利要求1所述的一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,所述PCR扩增模块(9)还设有:

浓度调控模块(12)和温度调控模块(13),其连接在所述PCR扩增模块(9)的输出端,所述浓度调控模块(12)和温度调控模块(13)的输出端均设置有采集模块,所述PCR扩增模块(9)包括浓度调控模块(12)和温度调控模块(13)。

5.根据权利要求1所述的一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,所述基因抽取模块(5)包括混样模块(19)和抽样模块(20),且混样模块(19)的输出端连接有抽样模块(20),所述微流控芯片(1)、基因抽取模块(5)和初始存储模块(3)依次通过导线电性串联。

6.根据权利要求1所述的一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,所述基因采集模块(2)、微流控芯片(1)和基因复制模块(4)依次通过导线电性串联,且基因采集模块(2)、微流控芯片(1)和初始存储模块(3)依次通过导线电性串联,所述微流控芯片(1)与基因抽取模块(5)通过导线电性连接。

7.根据权利要求1所述的一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,所述DNA切割模块(6)、Tn5转座酶提取模块(7)、引物调控模块(8)和PCR扩增模块(9)依次通过导线电性串联,且DNA切割模块(6)、Tn5转座酶提取模块(7)、引物调控模块(8)和PCR扩增模块(9)均与基因抽取模块(5)通过导线电性连接,并且DNA切割模块(6)、Tn5转座酶提取模块(7)、引物调控模块(8)和PCR扩增模块(9)均与DNA测序模块(10)通过导线电性连接。

8.根据权利要求1所述的一种单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,所述DNA序列存储模块(11)、质量控制模块(14)、DNA切割模块(6)和中转存储模块(17)依次通过导线电性串联,且中转存储模块(17)、微流控分析模块(15)和序列比对模块(16)依次通过导线电性串联。

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