[发明专利]一种热胁迫下水稻内参基因及其应用

说明书

本发明提供了一种热胁迫下水稻内参基因及其应用，涉及分子生物学领域，本发明提供一种热胁迫下水稻内参基因及其应用，以LOC_Os06g23160基因作为内参基因，该LOC_Os06g23160基因的基因序列如SEQ ID No1所示，LOC_Os06g23160基因是高温敏感品种HT13中表达最稳定的基因，而LOC_Os06g23160是一个比常见的内参基因如18S RNA更稳定的新候选基因。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域，具体而言，涉及一种热胁迫下水稻内参基因及其应用。

背景技术

水稻是养活世界绝大多数人口的最重要粮食作物之一，在亚洲广泛种植。其粮食营养价值高，食用价值和经济价值高。水稻产量一直是国内外水稻育种关注的主要问题之一。随着半矮秆基因(sd1)的发现和杂种优势的利用，水稻产量比过去有了很大提高。然而，随着全球人口的不断增加，如何进一步提高水稻产量和品质仍然是水稻育种的主要关注点和目的。

近年来，随着人类活动和工业化的加剧，环境问题日益突出。高温胁迫是影响水稻产量和品质的主要非生物因素之一。热害导致水稻频繁减产，也严重制约了稻米品质。在高温胁迫下，水稻的内部代谢和调控发生了显著变化，各种基因表达上调或下调。为了探索高温下水稻的基因表达，必须有合适的内参基因进行比较。

目前，稳定表达的管家基因如UBQ10和GAPDH通常被选择。然而，管家基因(包括肌动蛋白-1)的表达在特定环境中也会发生变化。某些基因如UBQ10在不同发育阶段的不同组织或细胞类型中的表达稳定性较低。因此，选择能够在高温下稳定表达的内参基因是研究水稻热应激反应分子机制的关键。

发明内容

本发明的目的在于提供一种热胁迫下水稻内参基因及其应用，解决背景所提出的至少一个技术问题。

本发明提供一种热胁迫下水稻内参基因，所述内参基因的基因序列如SEQ ID No1所示。

本发明还提供了上述热胁迫下水稻内参基因在荧光定量PCR检测中的应用。

进一步的，所述内参基因的荧光定量PCR引物的核苷酸序列为：

正向引物序列：ACACGTTACGCTACAAACTCTA；

反向引物序列：GAGATGCTAGGTGACGTGATTA。

本发明还提供了上述热胁迫下水稻内参基因在水稻基因定性检测中的应用。

本发明还提供了上述热胁迫下水稻内参基因在水稻基因定量检测中的应用。

本发明还提供了上述热胁迫下水稻内参基因在筛选水稻耐热基因的应用。

技术效果：

本发明提供一种热胁迫下水稻内参基因及其应用，以LOC_Os06g23160基因作为内参基因，该LOC_Os06g23160基因的基因序列如SEQ ID No 1所示，LOC_Os06g23160基是高温敏感品种HT13中表达最稳定的基因，而LOC_Os06g23160是一个比常见的内参基因如18SRNA更稳定的新候选基因。

附图说明

为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本发明的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。

图1为本发明实施例qRT-PCR分析所得各候选基因的CT值；

图2为本发明实施例Genorm计算的M值以及各候选内参基因稳定性排名；

图3为本发明实施例Genorm计算的成对变异V值；