[发明专利]一种CHST2-SLC9A9-AS2融合基因及其应用和检测试剂盒

说明书

本发明提供一种CHST2‑SLC9A9‑AS2融合基因及其应用和检测试剂盒，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。本发明首先发现、鉴定了急性淋巴细胞白血病中存在新融合基因CHST2‑SLC9A9‑AS2，该融合基因丰度与疾病进展阶段密切相关，可以作为急性淋巴细胞白血病的特异性分子标志物，进而开发了一款临床上可用于诊断、监测患者微小残留病(MRD)的试剂盒。试剂盒利用Taqman探针实时荧光PCR对急性淋巴细胞白血病患者体内CHST2‑SLC9A9‑AS2融合基因进行绝对定量，其检测特异性好、灵敏度高、方法简便高效、成本低廉，能够满足临床上的诊疗需求。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，尤其涉及一种急性淋巴细胞白血病融合基因及其应用和检测试剂盒。

背景技术

急性淋巴细胞白血病(ALL)是B或T系淋巴祖细胞恶性增殖引起的、最常见血液恶性肿瘤之一。患者由于正常外周血细胞缺乏，以发烧、反复感染、皮肤/粘膜出血，骨痛和关节痛为临床特征，纵隔肿块和中枢神经系统也常受累。儿童ALL患者化疗缓解率可达到80-90％，但成人ALL预后很差，总生存率为35％～55％，在60岁以上的成年人仅为30％。

为评估复发风险及预测临床预后，监测微小残留病变(MRD)是临床常用监测方法之一。其中白血病特异性融合基因的实时荧光定量聚合酶链反应(Quantitative Real-time PCR)分析是监测MRD的方法之一，且敏感性比流式细胞术高。并且随着分子遗传诊断学的迅速发展，目前在ALL中已经有BCR-ABL，BCL11B-TLX3,STIL-TAL1，NUP214-ABL1等融合基因被报道，但仍然有很大比例的ALL患者缺乏分子标志，从而为临床诊断和治疗预后带来很大困难。因此发现并监测与ALL相关的新融合基因对于病情诊断、治疗方案制定、疗效评价、预后评估及病变复发具有重要的临床意义。

CHST2(arbohydrate sulfotransferase 2)基因编码磺基转移酶蛋白，可催化非还原性N-乙酰氨基葡萄糖残基的硫酸化，参与炎症部位的淋巴细胞归巢作用。SLC9A9-AS2基因即SLC9A9(Sodium/hydrogen exchanger 9)的反义RNA2，目前已知SLC9A9基因在维持细胞器的离子平衡过程中发挥重要作用，其反义RNA2是一种lncRNA，目前对其功能的研究尚不深入，可能参与SLC9A9基因的表达调控。上述两个基因在ALL患者里形成了一种新融合基因CHST2-SLC9A9-AS2，迄今未见文献报道。

发明内容

本发明的第一个目的在于，提供一种急性淋巴细胞白血病融合基因CHST2-SLC9A9-AS2。

本发明的第二个目的在于，提供融合基因CHST2-SLC9A9-AS2在制备急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测制剂或试剂盒中的应用。

本发明的第三个目的在于，提供一种急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测试剂盒。

本发明第四个目的在于，提供一种非疾病诊断目的的检测CHST2-SLC9A9-AS2融合基因的方法。

为了实现上述第一个目的，本发明提供了一种CHST2-SLC9A9-AS2融合基因，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。

为了实现上述第二个目的，本发明提供了CHST2-SLC9A9-AS2融合基因在制备急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测制剂或试剂盒中的应用。部分急性淋巴细胞白血病患者携带融合基因CHST2-SLC9A9-AS2，其可以作为患者特异性的分子标志物，并应用于临床诊断、定期监测患者的微小残留病变。

为了实现上述第三个目的，本发明提供了一种急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测试剂盒，所述试剂盒含有检测CHST2-SLC9A9-AS2融合基因或检测其表达产物的试剂。

作为一个优选方案，所述试剂盒包括上游引物、下游引物、Taqman探针、内参、PCR反应缓冲液、阳性对照和阴性对照；