[发明专利]表观遗传因子在真核细胞中优化基因编辑工具的应用在审

专利信息
申请号: 202111281795.4 申请日: 2021-11-01
公开(公告)号: CN115678913A 公开(公告)日: 2023-02-03
发明(设计)人: 张学礼;毕昌昊;杨超;董兴啸 申请(专利权)人: 中国科学院天津工业生物技术研究所
主分类号: C12N15/85 分类号: C12N15/85;C12N15/62;C12N5/10
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 300000 天津*** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 表观 遗传因子 真核细胞 优化 基因 编辑 工具 应用
【权利要求书】:

1.重组基因编辑系统,其特征在于:所述重组基因编辑系统为在基因编辑系统的基础上改造得到的,所述重组基因编辑系统表达融合蛋白,所述融合蛋白含有序列特异性结合蛋白、诱导基因组修饰因子和表观遗传因子;所述重组基因编辑系统的基因编辑效率高于所述基因编辑系统。

2.根据权利要求1所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述基因编辑系统为碱基编辑系统。

3.根据权利要求1或2所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述序列特异性结合蛋白为Cas9蛋白;所述诱导基因组修饰因子为脱氨酶。

4.根据权利要求1或2所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述表观遗传因子为染色质重塑因子、组蛋白修饰因子和/或RNA修饰因子。

5.根据权利要求2或3或4所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述基因编辑系统为CBE碱基编辑系统、GBE碱基编辑系统;所述脱氨酶为胞苷脱氨酶;所述Cas9蛋白为nCas9。

6.根据权利要求4或5所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述染色质重塑因子为SOX2;所述组蛋白修饰因子为SETD2;所述RNA修饰因子为METTL3;

所述SOX2为A1)、A2)、A3)、A4)或A5)中的任一种:

A1)氨基酸序列为序列表中序列1的第280-596位;

A2)由编码序列是序列表中序列6的第838-1053位的核苷酸序列编码的蛋白质;

A3)由编码序列是序列表中序列7的第838-1188位的核苷酸序列编码的蛋白质;

A4)将A1)、A2)或A3)所示的氨基酸序列经过一个以上氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的且具有相同功能的由A1)、A2)或A3)衍生的或与A1)、A2)或A3)所示的蛋白质具有80%以上的同一性且具有相同功能的蛋白质;

A5)在A1)、A2)、A3)或A4)的N末端或/和C末端连接蛋白标签得到的融合蛋白质;

和/或,所述SETD2为B1)、B2)或B3)中的任一种:

B1)由编码序列是序列表中序列9的第25-915位的核苷酸序列编码的蛋白质;

B2)将B1)所示的氨基酸序列经过一个以上氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的且具有相同功能的由B1)衍生的或与B1)所示的蛋白质具有80%以上的同一性且具有相同功能的蛋白质;

B3)在B1)或B2)的N末端或/和C末端连接蛋白标签得到的融合蛋白质;

和/或,所述METTL3为C1)、C2)或C3)中的任一种:

C1)由编码序列是序列表中序列10的第25-1761位的核苷酸序列编码的蛋白质;

C2)将C1)所示的氨基酸序列经过一个以上氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的且具有相同功能的由C1)衍生的或与C1)所示的蛋白质具有80%以上的同一性且具有相同功能的蛋白质;

C3)在C1)或C2)的N末端或/和C末端连接蛋白标签得到的融合蛋白质。

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