[发明专利]表观遗传因子在真核细胞中优化基因编辑工具的应用在审
| 申请号: | 202111281795.4 | 申请日: | 2021-11-01 |
| 公开(公告)号: | CN115678913A | 公开(公告)日: | 2023-02-03 |
| 发明(设计)人: | 张学礼;毕昌昊;杨超;董兴啸 | 申请(专利权)人: | 中国科学院天津工业生物技术研究所 |
| 主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/62;C12N5/10 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
| 地址: | 300000 天津*** | 国省代码: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 表观 遗传因子 真核细胞 优化 基因 编辑 工具 应用 | ||
1.重组基因编辑系统,其特征在于:所述重组基因编辑系统为在基因编辑系统的基础上改造得到的,所述重组基因编辑系统表达融合蛋白,所述融合蛋白含有序列特异性结合蛋白、诱导基因组修饰因子和表观遗传因子;所述重组基因编辑系统的基因编辑效率高于所述基因编辑系统。
2.根据权利要求1所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述基因编辑系统为碱基编辑系统。
3.根据权利要求1或2所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述序列特异性结合蛋白为Cas9蛋白;所述诱导基因组修饰因子为脱氨酶。
4.根据权利要求1或2所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述表观遗传因子为染色质重塑因子、组蛋白修饰因子和/或RNA修饰因子。
5.根据权利要求2或3或4所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述基因编辑系统为CBE碱基编辑系统、GBE碱基编辑系统;所述脱氨酶为胞苷脱氨酶;所述Cas9蛋白为nCas9。
6.根据权利要求4或5所述的重组基因编辑系统,其特征在于:所述染色质重塑因子为SOX2;所述组蛋白修饰因子为SETD2;所述RNA修饰因子为METTL3;
所述SOX2为A1)、A2)、A3)、A4)或A5)中的任一种:
A1)氨基酸序列为序列表中序列1的第280-596位;
A2)由编码序列是序列表中序列6的第838-1053位的核苷酸序列编码的蛋白质;
A3)由编码序列是序列表中序列7的第838-1188位的核苷酸序列编码的蛋白质;
A4)将A1)、A2)或A3)所示的氨基酸序列经过一个以上氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的且具有相同功能的由A1)、A2)或A3)衍生的或与A1)、A2)或A3)所示的蛋白质具有80%以上的同一性且具有相同功能的蛋白质;
A5)在A1)、A2)、A3)或A4)的N末端或/和C末端连接蛋白标签得到的融合蛋白质;
和/或,所述SETD2为B1)、B2)或B3)中的任一种:
B1)由编码序列是序列表中序列9的第25-915位的核苷酸序列编码的蛋白质;
B2)将B1)所示的氨基酸序列经过一个以上氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的且具有相同功能的由B1)衍生的或与B1)所示的蛋白质具有80%以上的同一性且具有相同功能的蛋白质;
B3)在B1)或B2)的N末端或/和C末端连接蛋白标签得到的融合蛋白质;
和/或,所述METTL3为C1)、C2)或C3)中的任一种:
C1)由编码序列是序列表中序列10的第25-1761位的核苷酸序列编码的蛋白质;
C2)将C1)所示的氨基酸序列经过一个以上氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的且具有相同功能的由C1)衍生的或与C1)所示的蛋白质具有80%以上的同一性且具有相同功能的蛋白质;
C3)在C1)或C2)的N末端或/和C末端连接蛋白标签得到的融合蛋白质。
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