[发明专利]基于基因表达预测胰腺癌预后的评分模型及其应用在审

专利信息
申请号: 202110725171.0 申请日: 2021-06-29
公开(公告)号: CN113450916A 公开(公告)日: 2021-09-28
发明(设计)人: 杨承刚;陈丽媛 申请(专利权)人: 北京泱深生物信息技术有限公司
主分类号: G16H50/30 分类号: G16H50/30;C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 100176 北京市大兴区*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 基于 基因 表达 预测 胰腺癌 预后 评分 模型 及其 应用
【权利要求书】:

1.与胰腺癌预后相关的标志分子,其特征在于,所述标志分子包括IL20RB、PAK2、PSMD14、S100A3、STAT1。

2.评价胰腺癌预效果的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测权利要求1所述的标志分子的试剂。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,用于检测所述标志分子的试剂包括针对所述标志分子的引物对或特异性荧光探针。

4.胰腺癌预后效果的评价装置,其特征在于,所述评价装置包括:

数据输入模块,用于将与胰腺癌预后相关的标志分子的含量检测结果输入模型计算模块;所述标志分子包括IL20RB、PAK2、PSMD14、S100A3、STAT1。

5.根据权利要求4所述的评价装置,其特征在于,所述模型计算模块用于对输入的含量检测结果进行计算处理,得到被测患者的预后效果数据;所述模型计算模块采用的模型具体为:

Risk Score=0.06430982*IL20RB基因表达水平+0.46671589*PAK2基因表达水平+0.20944804*PSMD14基因表达水平+0.27092314*S100A3基因表达水平+0.13920846*STAT1基因表达水平。

6.根据权利要求4或5所述的评价装置,其特征在于,所述评价装置还包括结果输出模块,用于根据胰腺癌预后效果评价标准对被测患者的预后效果数据进行评价,输出评价结果。

7.权利要求5所述的模型的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:

(1)候选基因分析:在癌症表达图谱数据库中筛选免疫相关基因;

(2)筛选预后相关基因:利用单因素Cox分析获得与胰腺癌患者生存相关的免疫相关基因;

(3)建立模型:利用LASSOCox分析步骤(2)获得的预后相关基因,最终确定组成预后基因标签的基因构建所述模型,所述基因包括IL20RB、PAK2、PSMD14、S100A3、STAT1。

8.一种计算设备,包括存储器和处理器,所述存储器存储有程序,其特征在于,所述处理器执行所述程序时实现权利要求5中所述的模型。

9.一种计算机可读存储介质,其上存储有程序,其特征在于,所述程序被处理器执行时实现权利要求5中所述的模型。

10.一种应用,其特征在于,所述应用包括以下任一项:

1)权利要求1所述的标志分子在制备评价胰腺癌预效果的检测试剂盒中的应用;

2)权利要求1所述的标志分子在制备胰腺癌预后效果的评价装置中的应用;

3)权利要求1所述的标志分子在制备权利要求5中所述的模型中的应用;

4)权利要求1所述的标志分子在制备权利要求8所述的计算设备中的应用;

5权利要求1所述的标志分子在制备权利要求9所述的计算机可读存储介质中的应用;

6)权利要求5所述的模型在制备胰腺癌预后效果的评价装置中的应用;

7)权利要求5所述的模型在制备权利要求8所述的计算设备中的应用;

8)权利要求5所述的模型在制备权利要求9所述的计算机可读存储介质中的应用。

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