[发明专利]全切片病理图像读图系统

说明书

本发明提供一种全切片病理图像读图系统，包括驱动接口层、缓存层、RPC层以及应用程序接口层；其中，所述驱动接口层用于获取病理图像的文件标识符，根据所述文件标识符，确定文件格式，并确定所述文件格式对应的统一文件接口；所述缓存层用于基于所述统一文件接口，存储对应的病理图像至预设的内存，生成病理图像数据，并向RPC层应用和应用程序接口层优先提供病理图像数据；所述RPC层用于基于预设的RPC框架内的调用机制，获取并调用病理图像数据，确定调用结果；其中，所述调用机制包括本地调用和RPC调用；所述应用程序接口层用于对所述调用结果进行统一封装，生成应用程序接口，并向驱动接口层、缓存层和RPC层统一提供。

技术领域

本发明涉及数字化病理学、分布式存储系统和RPC技术领域，特别涉及一种全切片病理图像读图系统。

背景技术

近年来，病理学已经进入数字化时代，全切片病理图像是数字化病理学的基础，高质量病理图像为病情诊断、远程会诊、病理数据共享、教学等多方面提供了便利条件；同时，病理图像数据的积累为机器学习、深度学习等计算机辅助诊断提供了大数据支持，相比于其他图像，病理图像具有多层级、高分辨率、大尺寸的特点，安全存储、快速读取的优点。但是，病理相关的计算机辅助软件均已读图为基础，不同扫描仪厂商的病理图像格式以及应用程序接口各异，给进一步软件开发增加了难度，因此，为各种不同格式的病理图像提供统一的读图接口十分必要。

发明内容

本发明提供一种全切片病理图像读图系统，以解决上述背景技术出现的问题。

本发明提供一种全切片病理图像读图系统，包括：

驱动接口层：用于获取病理图像的文件标识符，根据所述文件标识符，确定文件格式，并确定所述文件格式对应的统一文件接口；

缓存层：用于基于所述统一文件接口，存储对应的病理图像至预设的内存，生成病理图像数据，并向RPC层应用和应用程序接口层优先提供病理图像数据；

RPC层：用于基于预设的RPC框架内的调用机制，获取并调用病理图像数据，确定调用结果；其中，

所述调用机制包括本地调用和RPC调用；

应用程序接口层：用于对所述调用结果进行统一封装，并向驱动接口层、缓存层和RPC层提供统一的应用程序接口。

优选的，所述驱动接口层包括：

图像存储模块:用于获取病理图像所在的文件存储系统，查找所述文件存储系统的文件标识符，并根据所述文件标识符，将对应的文件存储系统进行统一的接口封装，确定文件系统接口；

图像格式模块:用于根据所述文件系统接口，读取并解析对应的文件存储系统，确定文件格式；其中，

所述文件格式至少包括：TIFF、TIF、SVS、KFB、TMAP、MDSS、MDSX和NDPI；

驱动接口模块:用于基于预设的格式验证机制和文件表识符，验证病理图像的文件格式，确定筛选病理图像，并格式解析所述筛选病理图像的文件格式，生成统一文件接口。

优选的，所述图像存储模块包括:

存储介质单元:用于获取病理图像所在的文件存储系统，确定所述文件存储系统的存储介质；

文件标识符单元:用于根据所述存储介质，生成文件存储系统的文件标识符；

应用编程接口单元:用于根据所述文件标识符，为对应的文件存储系统提供应用编程接口；

优先存储数据单元:用于基于ALLUXIO内存的层次化架构，通过所述应用编程接口，优先存储病理图像，确定优先存储数据；

文件系统接口单元:用于基于所述文件标识符，将优先存储数据和对应的文件存储系统进行统一的接口封装，确定文件系统接口。