[发明专利]一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法在审

专利信息
申请号: 202110453194.0 申请日: 2021-04-26
公开(公告)号: CN114218736A 公开(公告)日: 2022-03-22
发明(设计)人: 徐占;陈德训;孙唯哲;李芳;刘鑫;徐金秀;郭恒;陈鑫;赵朋朋;杨雨灵;韩笑颖 申请(专利权)人: 无锡江南计算技术研究所
主分类号: G06F30/20 分类号: G06F30/20;G06F15/16;G06F119/08
代理公司: 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 代理人: 王健
地址: 214038 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 针对 海洋 模式 roms 优化 方法
【说明书】:

发明公开一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法,包括以下步骤:S1、查找、确认并分析海洋模式中的热点函数,找出热点函数的特点;S2、根据S1中的分析结果,找出排名前三的热点函数都是属于计算密集型、不涉及数据相关性、但存在跨步访存问题的函数;S3、对S2中获得的热点函数的计算部分,利用循环段程序重构,将跨步访存变为连续访存;S4、利用编译指示语句对循环段进行众核优化,将循环段计算任务分发到不用的众核上;S5、对编译指示语句进行调优,通过多轮对比测试,作为最终的优化版本,可供模式其他算例使用。本发明在提升主核访存性能的同时,也有利于从核进行灵活的分块和合并等操作,还可以达到众核加速的效果。

技术领域

本发明涉及一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法,属于众核优化技术领域。

背景技术

ROMS(Regional Ocean Modeling System)是一个开源的三维区域海洋模型,由Rutgers大学海洋与海岸科学研究所与UCLA两校共同研究开发,功能强大,被广泛应用于海洋及河口地区的水动力及水环境模拟,可以模拟不同尺度的运动,如全球尺度的环流运动、中尺度的水位与流场变化,也可以计算小尺度内波、混合等过程。

ROMS模式是在垂向静压近似和Boussinesq假设下,按照有限差分近似求自由表面Reynolds(雷诺数)平均的原始Navier-Stokes方程。模型在水平方向使用正交曲线网格,垂向采用地形拟合的可伸缩坐标系统(S坐标系),并针对不同应用提供多种垂向转换函数和拉伸函数。

作为开源软件,ROMS的并行只在MPI层实现,在更高精度前提下,仅仅依靠MPI不能满足时效性的要求,需要发挥异构众核的强大计算能力来满足对性能的提升需求。

气象类课题都面临时效性的问题,ROMS海洋模式也不例外。随着网格分辨率的提升,计算量呈指数倍地增加,为了在更短的时间内,获得更多的结果数据,单纯依靠增大进程规模已经不能满足课题的实际需求,需要在众核层面进行进一步的优化来满足实际需要。

发明内容

本发明的目的是提供一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法,其在提升主核访存性能的同时,也有利于从核进行灵活的分块和合并等操作,还可以达到众核加速的效果。

为达到上述目的,本发明采用的技术方案是:提供一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法,包括以下步骤:

S1、利用热点函数工具和手动插装相结合的方法查找、确认并分析海洋模式中的热点函数,找出热点函数的特点,包括:计算密集型或者通信密集型,访存是否连续,I/O特点和大小,是否涉及数据相关性;

S2、根据S1中的分析结果,找出排名前三的热点函数都是属于计算密集型、不涉及数据相关性、但存在跨步访存问题的函数;

S3、对S2中获得的热点函数的计算部分,利用循环段程序重构,将跨步访存变为连续访存;

S4、利用编译指示语句对循环段进行众核优化,将循环段计算任务分发到不用的众核上;

S5、对编译指示语句进行调优,通过多轮对比测试,确定加速效果最好的语句组合,作为最终的优化版本,可供模式其他算例使用。

由于上述技术方案的运用,本发明与现有技术相比具有下列优点:

本发明一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法,通过对热点函数中循环段的程序重构,在提升主核访存性能的同时,也有利于从核进行灵活的分块和合并等操作,还可以达到众核加速的效果。

附图说明

附图1为本发明一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法的流程示意图。

具体实施方式

实施例:本发明提供一种针对海洋模式ROMS众核优化的方法,具体包括以下步骤:

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