[发明专利]一种用于结直肠癌及腺瘤早期筛查的蛋白定量检测方法有效
申请号: | 202110021899.5 | 申请日: | 2021-01-08 |
公开(公告)号: | CN112881692B | 公开(公告)日: | 2022-11-22 |
发明(设计)人: | 曾柳红;唐美芳;叶明芝 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因股份有限公司;深圳华大医学检验实验室;广州华大基因医学检验所有限公司 |
主分类号: | G01N33/574 | 分类号: | G01N33/574;G01N33/68;G01N30/72;G01N30/34;G01N30/06 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 张立娜 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 直肠癌 腺瘤 早期 蛋白 定量 检测 方法 | ||
本发明公开了一种用于结直肠癌及腺瘤早期筛查的蛋白定量检测方法。本发明采用label‑free质谱的技术对结直肠癌及其腺瘤组织进行大规模蛋白组的鉴定及定量,筛选出32个蛋白标志物,特别是其中3个蛋白即TFR1、SAHH及HV307,在结直肠癌及腺瘤的组织、血浆不同样本类型中均检出一致,且与对照组具显著表达差异,ROC曲线AUC面积最高达1。本发明筛选的蛋白标志物在结直肠癌及其癌前病变腺瘤的早期筛查性能优于传统蛋白肿瘤标志物。本发明采用MRM质谱技术对测试血浆样本进行靶蛋白鉴定及定量,取代了传统ELISA技术,不依赖于抗体,基于物理的质谱信号,灵敏度高、重现性好、准确度高、通量高。
技术领域
本发明涉及生物医学领域,具体涉及一种用于结直肠癌及腺瘤早期筛查的蛋白定量检测方法。
背景技术
结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)又称大肠癌,是指发生在人体下消化道结肠或直肠部位的恶性肿瘤。早期症状不明显,随着癌肿的增大而表现排便习惯改变、便血、腹泻、腹泻与便秘交替、局部腹痛等症状,晚期则表现贫血、体重减轻等全身症状。2018年全球结直肠癌发病率居恶性肿瘤第3位,死亡率居第2位。结直肠癌的经典发病模式为肠腺上皮-腺瘤-腺癌-转移癌,是一个多因素、多阶段、多基因变异所致的病理过程和结果。研究指出,早期大肠癌治疗后的五年生存率可达90%,而晚期远端转移的肠癌治疗后5年生存率只有不到20%。每1%的腺瘤检出率,能够减少3%的结肠癌发病率和4%的死亡率。《中国早期结直肠癌筛查流程专家共识意见(2019,上海)》显示,目前我国85%以上结直肠癌发现即属晚期,我国CRC五年生存率低于40%,早期结直肠癌诊断率低于10%。世界卫生组织也明确指出,如果能早期诊断并及时治疗,90%~95%的肿瘤是可以治愈的。肠癌筛查不仅提高医学资源使用率,更重要地是提高肿瘤早诊率,减轻社会负担。
结直肠癌早期筛查方法可分为粪便检查和全部(或部分)结构性检查,其中粪便检查包括:愈创木脂法便隐血试验、免疫化学便隐血试验、粪便中DNA检测;全部结构性检查:乙状结肠镜检查、结肠镜检测、钡灌肠、CT结肠成像检查。目前在用的传统方法都有各自的弊端:肠镜成像对技术及经验依赖高,具有侵入性或放射性,接受度低,并且检测灵敏度低,仪器成本要求高。大便检测技术灵敏度低,易漏检。随着科技的发展,肿瘤分子标志物检测也进入到结直肠癌的检测方法中。
结直肠癌早期筛查核酸检测技术主要有利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)、高通量测序等技术检测粪便或血浆样本类型的基因突变、甲基化、基因表达等特征,有单靶点和多靶点方案,也可与粪便隐血试验免疫化学法联合检测。但目前几乎没有用途为结直肠癌普通或高风险人群筛查的蛋白标志物及其相关产品或服务在临床或体检机构应用。
中心法则的标准流程是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。DNA制造RNA,RNA制造蛋白质,蛋白质反过来协助前两项流程,并协助DNA自我复制。蛋白水平的异常表达可能参与了肿瘤的发生与发展。研究肠癌蛋白水平的表达、蛋白标志物的筛选以及临床样本的验证,有助于更好地理解结直肠癌的发生发展进程,在临床实践中也适合开发出非侵入性、高性能的蛋白标志物。
肿瘤标志物是指特征性存在于恶性肿瘤细胞,或由恶性肿瘤细胞异常产生的物质,或是宿主对肿瘤的刺激反应而产生的物质,并能反映肿瘤发生、发展,监测肿瘤对治疗反应的一类物质。肿瘤标志物存在于肿瘤患者的组织、体液和排泄物中,能够用免疫学、生物学及化学的方法检测到。临床上常用的肿瘤标志物通常为蛋白标志物,比如血清癌胚抗原(CEA)、甲胎蛋白(AFP)、CA-153、CA-125、CA-50等,癌胚抗原(CEA)等,来源主要有:1)肿瘤细胞的代谢产物,如:糖酵解产物、组织多肽抗原、核酸分解产物。2)分化紊乱的细胞基因产物,如:异位的ACTH片段,甲胎蛋白、癌胚抗原、胎儿同工酶。3)肿瘤细胞坏死崩解释放进入血液循环的物质,主要是某些细胞骨架蛋白成分,如细胞角质素片段抗原21-1(Cyfra21-1),多胺类物质。4)肿瘤宿主细胞的细胞反应性产物。
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