[发明专利]生物细胞振荡荧光分析在审
| 申请号: | 202080058604.5 | 申请日: | 2020-06-25 |
| 公开(公告)号: | CN114375390A | 公开(公告)日: | 2022-04-19 |
| 发明(设计)人: | 奥克萨纳·西连科;卡罗勒·克里滕登;克里蒂卡·斯里达;鲍里斯·布雷斯登 | 申请(专利权)人: | 分子装置有限公司 |
| 主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G01N33/487 |
| 代理公司: | 北京天昊联合知识产权代理有限公司 11112 | 代理人: | 麦善勇;张天舒 |
| 地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 生物 细胞 振荡 荧光 分析 | ||
1.一种分析方法(50),所述方法包括:
检测(54)表示与一个或多个生物细胞(72)相关联的振荡离子流的荧光(91),以产生描述振荡模式(110)的一系列数据点(120);
计算(60)所述振荡模式(110)的一系列斜率;以及
使用所述一系列斜率来识别(62)所述振荡模式(110)的波峰(118、150a、150b)。
2.如权利要求1所述的方法,其中,计算(60)使用滑动窗口(122)来定义所述一系列数据点(120)的子集(126),根据所述子集来计算所述一系列斜率。
3.如权利要求2所述的方法,还包括从多个允许的尺寸中选择所述滑动窗口(122)的尺寸,其中,所述滑动窗口(122)的尺寸对应于来自所述一系列数据点(120)的由所述滑动窗口(122)包含的数据点(126)的数量。
4.如权利要求3所述的方法,其中,所述滑动窗口(122)的尺寸由处理器(96)基于所述振荡模式(110)中的噪声水平和/或所述一系列数据点(120)的采样间距来自动地分配,并且其中,所述处理器(96)还计算所述一系列斜率并识别所述波峰(118、150a、150b)。
5.如权利要求3所述的方法,其中,选择所述滑动窗口(122)的尺寸由用户执行,并且被传送到处理器(96),所述处理器还计算所述一系列斜率并且识别所述波峰(118、150a、150b)。
6.如权利要求1所述的方法,其中,在计算(60)一系列斜率之前,不对所述一系列数据点(120)进行滤波降噪。
7.如权利要求1所述的方法,其中,所述波峰包括一系列主峰(118),其中,所述振荡模式(110)包括一系列事件(138),每个事件仅包括所述主峰(118)中的一个,所述方法还包括确定所识别的波峰的次峰(150a、150b)的至少一个方面,在事件(138)内,每个次峰在所述主峰(118)中的一个之后。
8.如权利要求7所述的方法,其中,所述次峰(150a、150b)的至少一个方面与所述振荡模式(110)内的所述次峰(150a、150b)的数量、频率或周期有关。
9.如权利要求7所述的方法,其中,所述振荡模式(110)针对每个事件(138)与预定的触发水平(144)交叉两次,并且其中,所述触发水平(144)是相对于所述振荡模式(110)的基线(116)设置的。
10.如权利要求1所述的方法,其中,识别(62)波峰(118、150a、150b)包括搜索所述一系列斜率内的斜率的从正到负的转变或者从负到正的转变。
11.如权利要求10所述的方法,其中,识别(62)波峰包括滤波与所述转变相关联的波峰,以获得被认为有效的波峰集合。
12.如权利要求11所述的方法,其进一步包括确定用于所述被认为有效的波峰集合的波峰相关参数的值。
13.如权利要求1所述的方法,还包括用钙指示剂标记(52)所述一个或多个生物细胞(72),其中,所述荧光(91)由所述钙指示剂发射。
14.如权利要求1所述的方法,其中,所述一个或多个生物细胞(72)包括一个或多个心肌细胞或神经元。
15.如权利要求1所述的方法,其中,所述振荡模式(110)包括一系列事件(138),每个事件包括单个主峰(118),并且其中,所述振荡模式(110)包括一个或多个次峰(150a、150b),每个次峰包括在所述一系列事件(138)的一个事件中,所述方法还包括确定(64)与所述一个或多个次峰(150a、150b)相关的一个或多个参数的至少一个值。
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