[发明专利]一种诊断引导群稀疏多任务学习方法在审

专利信息
申请号: 202011624927.4 申请日: 2020-12-31
公开(公告)号: CN112786114A 公开(公告)日: 2021-05-11
发明(设计)人: 林安石;孔薇 申请(专利权)人: 上海海事大学
主分类号: G16B50/00 分类号: G16B50/00;G16B40/00;G16B20/20;G06F17/18;G06F17/16
代理公司: 上海互顺专利代理事务所(普通合伙) 31332 代理人: 成秋丽
地址: 201306 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 诊断 引导 稀疏 任务 学习方法
【权利要求书】:

1.一种诊断引导群稀疏多任务学习方法,其特征在于,包括:

步骤一、建立基于影像表型连续响应的回归分析计算公式;

步骤二、基于被试样本与诊断标签之间的关系信息,建立正则化项来利用类级别的诊断信息,当被试样本在原始诊断特征空间中相似时,其各自的响应值也相似;

步骤三、使用正则化的形式来处理SNP之间的群体关联,将每个SNP作为一个特征,将每个QT作为一个响应变量,建立基于多特征和多响应的诊断引导信息多任务学习模型。

2.如权利要求1所述的诊断引导群稀疏多任务学习方法,其特征在于,步骤一中的回归分析计算公式:受试参与者的SNP数据X=[x1,...,xN]T∈RN×d和成像表型数据Y=[y1,...,yN]T∈RN×c,其中N是参与者的数量,d是SNP的数量,c是显型的成像数量,线性回归模型:Y=XW+ε,其中,W是分配给各个特征的系数矩阵,ε是误差项,施加L2范数正则化,如下所示:

其中,权重矩阵W是测量第i个SNP在预测第j个成像表型反应中的相对重要性,γ0是一个权衡参数。

3.如权利要求2所述的诊断引导群稀疏多任务学习方法,其特征在于,步骤二中建立正则化项来利用类级别的诊断信息:

其中,S=[Sij]∈RN×N表示每对样本之间相似性的相似性矩阵,L表示拉普拉斯矩阵:

L=D-S

其中,D是元素定义为的对角矩阵,相似矩阵定义如下:

4.如权利要求3所述的诊断引导群稀疏多任务学习方法,其特征在于,使用正则化方法对SNP进行分组来挖掘基因型中的相关结构:其中,SNP被划分为K个组SNP通过对LD相关系数r2进行阈值化分组,r2≥0.2的相邻SNP形成一个群;

是有序的且连接后的W可表示为式中则上述等式重写如下:G2,1范数是关于划分的矩阵,其定义如下:

等式改写如下:通过正则化l2,1范数来联合选择多个任务的特征:其中,第一项是回归损失,第二项综合了所有任务的一组特征的回归系数,并结合了遗传连锁产生的特征分组信息,第三项惩罚每个个体特征的所有回归系数,以在多个学习任务中选择特征。

5.如权利要求4所述的诊断引导群稀疏多任务学习方法,其特征在于,诊断引导的群体稀疏多任务学习模型,如下所示:

其中,γ1,γ2和γ3表示正则化项的控制参数,它们的值通过训练数据的内部交叉验证来确定。

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