[发明专利]一种基于隐空间重投影的遗传代谢病筛查方法在审
申请号: | 202011136152.6 | 申请日: | 2020-10-22 |
公开(公告)号: | CN112151192A | 公开(公告)日: | 2020-12-29 |
发明(设计)人: | 尹建伟;林博;舒强;李莹;邓水光;蒋萍萍 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G16H50/80 | 分类号: | G16H50/80;G16H50/50;G06N3/04;G06N3/06;G06N3/08 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 万尾甜;韩介梅 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 空间 投影 遗传 谢病 方法 | ||
1.一种基于隐空间重投影的遗传代谢病筛查方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)构建模型:
构建r个基础网络,其中每个基础网络第k层的神经元个数固定为n,k大于等于2;
构建1个含有m层结构的特征映射网络,其中m为大于等于3的奇数,第i层的神经元个数与(m-i+1)层的神经元个数相同,1≤i<(m+1)/2;
构建一个含有c层结构的风险评估网络,其中第1层的神经元个数等于特征映射网络第(m+1)/2层的神经元个数,最后一层的神经元个数为1,c大于等于2;
2)模型训练:
对于r个不同的遗传代谢病筛查中心,使用各自实验室得到的串联质谱检测数据,分别训练r个基础网络;
复制r个基础网络的第1-k层并与特征映射网络的第1层进行连接,即每个基础网络第k层的输出作为特征映射网络第1层的输入;其中r个基础网络的第1-k层,共r*k层的神经元参数在训练时不进行更新;将特征映射网络的第(m+1)/2层与风险评估网络的第1层进行连接;完成上述连接步骤后形成的网络组合称为主网络;
基础网络和风险评估网络的损失函数的计算公式为:
其中N为一个筛查中心检测数据的数据总量,yi和pj分别为第j条数据的标签与网络预测的概率值;
特征映射网络的损失函数的计算公式为:
其中N为一个筛查中心检测数据的数据总量,xj和分别为特征网络的输入数据与映射数据;
主网络的损失函数计算公式为:
其中λ>0是惩罚系数;
所有网络模型的训练均使用适应性矩估计法Adam对网络参数进行优化;
3)模型使用步骤:
如果一个遗传代谢病筛查中心有历史检测数据,则使用历史检测数据训练一个新基础网络,其中新基础网络的损失函数为
将新基础网络的第1-k层与已训练的特征映射网络的第1层进行连接,使用历史检测数据进行训练,其中特征映射网络损失函数为新基础网络第1-k层的神经元参数在训练时不进行更新;
将特征映射网络的第(m+1)/2层与风险评估网络的第1层进行连接,并对新的筛查数据进行风险预测;
如果一个遗传代谢病筛查中心没有历史检测数据,则将新的筛查数据分别输入已训练的r个基础网络的第1-k层,然后将r个输出结果求平均值;
将平均值作为特征映射网络的输入得到中间结果,将该中间结果输入风险评估网络得到筛查数据的风险预测值。
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