[发明专利]甘蔗SPSB基因同等型2的鉴定及应用在审

专利信息
申请号: 202011134999.0 申请日: 2020-10-22
公开(公告)号: CN112210559A 公开(公告)日: 2021-01-12
发明(设计)人: 刘洪博;陆鑫;李纯佳;毛钧;李旭娟;林秀琴;徐超华;孔春艳;刘新龙 申请(专利权)人: 云南省农业科学院甘蔗研究所
主分类号: C12N15/29 分类号: C12N15/29;C12N15/11;C12Q1/686;C12Q1/6895
代理公司: 昆明正原专利商标代理有限公司 53100 代理人: 于洪;陈左
地址: 661699 云南省红河*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 甘蔗 spsb 基因 同等 鉴定 应用
【权利要求书】:

1.甘蔗SPSB基因同等型2,其特征在于,所述的甘蔗SPSB基因同等型2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

2.根据权利要求1所述的甘蔗SPSB基因同等型2,其特征在于,该基因的表达序列中含有如SEQ ID NO.2所示核苷酸序列。

3.检测权利要求1或2甘蔗SPSB基因同等型2的引物。

4.根据权利要求3所述的检测甘蔗SPSB基因同等型2的引物,其特征在于:针对SEQ IDNO.2所设计的引物。

5.含有权利要求3或4所述的检测甘蔗SPSB基因同等型2的引物的试剂盒。

6.一种鉴定权利要求1所述的甘蔗SPSB基因同等型2的方法,其特征在于,包括如下步骤:

步骤(1),提取待检测样本成熟期叶片的总RNA,然后反转录,得到cDNA;

步骤(2),以cDNA为模板,采用权利要求3或4所述的检测甘蔗SPSB基因同等型2的引物进行PCR扩增;

步骤(3),对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,之后测序检测,鉴定甘蔗SPSB基因同等型2。

7.根据权利要求6所述的鉴定甘蔗SPSB基因同等型2的方法,其特征在于,PCR扩增体系如下:10×Buffer 5μL;dNTP 2.5mM 5μL;KOD酶 1μL;上游引物10μmol 1.5μL;下游引物10μmol 1.5μL;MgSO4 2μL;模板10ng/μL 1.0μL;ddH2O 33μL;总体积50μL;

PCR扩增程序为:94℃预变性2min;94℃变性15s,60℃退火30s,68℃延伸1.5min,共35个循环;68℃延伸5min。

8.根据权利要求6所述的鉴定甘蔗SPSB基因同等型2的方法,其特征在于:步骤(3)中,根据电泳检测的结果,当出现大小为2381bp片段,在SEQ ID NO.2序列上所设计的引物作为cDNA检测甘蔗SPSB基因同等型2的上游或下游引物。

9.权利要求1或2所述的甘蔗SPSB基因同等型2、权利要求6-8所述的鉴定甘蔗SPSB基因同等型2的方法在SPSB基因表达水平上的等位基因分型,SPSB基因同等型2的表达研究和分子辅助育种的标记制备中的应用。

10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,利用甘蔗YZ14-401 SPSB基因同等型2中SEQ ID NO.2所示的第5内含子的保留序列设计特异引物,进而进行SPSB基因表达水平上的等位基因分型,SPSB基因同等型2的表达研究和分子辅助育种的标记制备。

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