[发明专利]一种基于交叉注意力机制的乳腺肿块分割方法有效
申请号: | 202011081302.8 | 申请日: | 2020-10-09 |
公开(公告)号: | CN112201328B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
发明(设计)人: | 胡海蓉;胡红杰;李康安 | 申请(专利权)人: | 浙江德尚韵兴医疗科技有限公司 |
主分类号: | G16H30/20 | 分类号: | G16H30/20;G06T7/00;G06T7/12;G06N3/04 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 周世骏 |
地址: | 310012 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 交叉 注意力 机制 乳腺 肿块 分割 方法 | ||
1.一种基于交叉注意力机制的乳腺肿块分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)制作数据集
取足量的乳腺X射线DICOM图像,经脱敏处理后转换为RGB三原色图像;按临床医学判断标准对乳腺X射线图像肿块进行交叉标注,然后制作成为训练数据集;在训练数据集中,针对每个病案生成与原图像大小一致的掩码二值图像;该二值图像中像素不为0的(x0,y0)位置表示原始图像相同位置存在肿块,反之则不存在肿块;
(2)交叉注意力机制预处理
从步骤(1)得到的数据集中,取N张样本及其对应肿块的掩码二值图像进行归一化处理,N不小于40000;从归一化处理后的图像中,取每个病例的单侧乳房CC位和MLO位两幅乳腺X射线图像,即左右乳房的CC位和MLO位两幅图像各自组成一个图像批次;将两幅图片的大小零填充到相同的长宽,输入图像的批尺寸为2;
(3)构建深度卷积神经网络EfficientNet
构建EfficientNet-B0网络结构,该网络组成包括:一个卷积核大小为3x3、滑动步长为2x2、填充大小为1x1的卷积层;7个移动反转瓶颈块,一个全卷积层,一个逻辑回归层;EfficientNet-B0网络结构是由移动反转瓶颈块组成网络主干,每个移动反转瓶颈块均由两个常规卷积、一个深度可分离卷积和一个注意力模块这三部分组成;
(4)调整图像网络数据集的预训练权值分布
使用在图像网络数据集上预训练好的权值模型文件,设深度卷积神经网络的注意力单元中所有卷积层的权值Wa尺寸为(C1,C2),调整图像网络数据集预训练权值Wb尺寸为(2C1,2C2),且相应的将尺寸为(C2,1)的原偏置Ba,调整为Bb=[Ba Ba],调整后的Bb尺寸为(2C2,1);同时将注意力单元的所有卷积层的数据顺序由(N,C,H,W)设置为(N/2,C*2,H,W),将卷积层卷积核的数据顺序由(Cout,Cin,Hk,Wk)设置为(2*Cout,2*Cin,Hk,Wk);
(5)利用步骤(2)中的数据预处理结果,调整步骤(4)中的预训练权值分布,训练步骤(3)中的深度卷积神经网络;
(6)利用深度卷积神经网络对待检测的X射线影像进行推理
将待检测的乳腺X射线图像的单侧乳房CC位和MLO位零填充为统一大小,然后进行归一化处理;输入到步骤(5)经过训练的深度卷积神经网络,输出取值范围为0-1的概率图;取0.5的阈值将概率图二值化,在二值化后的概率图中,白色区域表示在原始乳腺X射线图像中的对应位置处存在肿块病变,反之则不存在肿块。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中对乳腺X射线图像肿块数据进行交叉标注的操作,是由多名具备临床资质的执业医师按临床医学判断标准执行;每一幅乳腺X射线图像均由多人标注,并从中选取标注一致的样本用于制作训练数据集。
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