[发明专利]基因对的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质

说明书

本申请涉及一种基因对的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质。方法包括：获取至少两个的第一基因对集合；所述第一基因对集合是利用k‑TSP算法对基因对筛选样本进行筛选得到的；各个第一基因对集合对应不同的基因对筛选样本；根据各个第一基因对集合分别构建对应的k‑TSP分类器；利用所述k‑TSP分类器，分别对所述基因对筛选样本进行筛选，得到至少两个的第二基因对集合；各个第二基因对集合对应不同的基因对筛选样本；在所述第二基因对集合中，选取出现次数达到预设值的目标基因对。采用本方法能够在使用k‑TSP算法筛选基因对时，得到噪声较小的基因对，避免出现较大噪声基因对。

技术领域

本申请涉及计算机信息处理技术领域，特别是涉及一种基因对的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质。

背景技术

最高得分对(k-Top Scores Gene Pairs,k-TSP)算法可以用于对基因进行分析，具体地，k-TSP算法将基因表达定量值转换为两个基因相对表达趋势的二进制值。使用k-TSP算法可以筛选基因对，根据筛选出来的基因对，构建基因对分类模型，k-TSP算法可以有效消除由于不同试验方案、平台和测量方法批次引起的批次效应问题；但是，将基因组合成基因对会形成了多种可能的基因对(例如，N个基因可以形成0.5N*(N-1)个基因对)，由于数据存在随机性的问题，在使用k-TSP算法筛选基因对的过程中，会产生许多导致基因对分类模型不准确的基因对，也就是会产生噪声较大的基因对，可见，传统使用k-TSP算法筛选基因对，会得到许多噪声较大的基因对。

发明内容

基于此，有必要针对上述技术问题，提供一种能够在使用k-TSP算法筛选基因对时，避免出现较大噪声基因对的基因对的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质。

第一方面，提供一种基因对的筛选方法，包括：

获取至少两个的第一基因对集合；所述第一基因对集合是利用k-TSP算法对基因对筛选样本进行筛选得到的；各个第一基因对集合对应不同的基因对筛选样本；

根据各个第一基因对集合分别构建对应的k-TSP分类器；

利用所述k-TSP分类器，分别对所述基因对筛选样本进行筛选，得到至少两个的第二基因对集合；各个第二基因对集合对应不同的基因对筛选样本；

在所述第二基因对集合中，选取出现次数达到预设值的目标基因对。

第二方面，提供一种基因对的筛选装置，包括：

基因对获取模块，用于获取至少两个的第一基因对集合；所述第一基因对集合是利用k-TSP算法对基因对筛选样本进行筛选得到的；各个第一基因对集合对应不同的基因对筛选样本；

分类器构建模块，用于根据各个第一基因对集合分别构建对应的k-TSP分类器；

基因对筛选模块，用于利用所述k-TSP分类器，分别对所述基因对筛选样本进行筛选，得到至少两个的第二基因对集合；各个第二基因对集合对应不同的基因对筛选样本；

基因对选取模块，用于在所述第二基因对集合中，选取出现次数达到预设值的目标基因对。

第三方面，提供一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现以下步骤：

获取至少两个的第一基因对集合；所述第一基因对集合是利用k-TSP算法对基因对筛选样本进行筛选得到的；各个第一基因对集合对应不同的基因对筛选样本；

根据各个第一基因对集合分别构建对应的k-TSP分类器；

利用所述k-TSP分类器，分别对所述基因对筛选样本进行筛选，得到至少两个的第二基因对集合；各个第二基因对集合对应不同的基因对筛选样本；