[发明专利]一种生物信息变异位点数据格式转换方法

权利要求书

1.一种生物信息变异位点数据格式转换方法，其特征在于：所述转换方法的步骤包括有：

S1：通过转换系统的配置文件输入配制数据，确定转换系统参考序列文件和指定数据路径、相关软件的调用等参数；

S2：启动转换系统，转换系统根据指定数据路径获取相关数据；

S3：识别相关数据类型，并根据数据类型和配置文件数据确定调用的程序和顺序；

S4：依次调用并配置程序相关参数，读取上一步获得的相关数据后运行程序，获得特定数据类型的数据并按照配置文件中路径保存数据；

S5：运行结束，输出SNP分型数据。

2.根据权利要求1所述的一种生物信息变异位点数据格式转换方法，其特征在于：所述转换系统包括有数据识别模块、配置模块和程序调用模块，所述配置模块根据用户输入的配置文件数据对转换系统和相关应用程序的参数进行配置，所述数据识别模块根据配置模块指定的路径调取数据并识别，根据识别需要调用的程序，所述程序调用模块设置有与程序对应的调用单元，所述调用单元在调用对应程序时先根据配置文件数据对程序进行配置。

3.根据权利要求1所述的一种生物信息变异位点数据格式转换方法，其特征在于：所述程序运算结束后输出并保存特定类型的数据，然后返回给转换系统一个数据保存路径，所述转换程序在调用下一个程序时将该数据保存路径指定为下一个程序的数据读取路径。

4.根据权利要求1所述的一种生物信息变异位点数据格式转换方法，其特征在于：所述配置系统可以通过配置文件修改最终输出的文件类型。

5.根据权利要求1所述的一种生物信息变异位点数据格式转换方法，其特征在于：所述配置系统由Python编程语言实现对各个软件的高效串接和自动化操作。