[发明专利]一种可视化编辑小提琴图的生成方法及系统在审
申请号: | 201911193280.1 | 申请日: | 2019-11-28 |
公开(公告)号: | CN111061472A | 公开(公告)日: | 2020-04-24 |
发明(设计)人: | 夏昊强;周煌凯;高川;陶勇;罗玥;程祖福;邢燕;曾川川 | 申请(专利权)人: | 广州基迪奥生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F8/34 | 分类号: | G06F8/34;G06F16/2458;G06F16/248 |
代理公司: | 广州容大专利代理事务所(普通合伙) 44326 | 代理人: | 刘新年 |
地址: | 510000 广东省广州市广州国*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 可视化 编辑 小提琴 生成 方法 系统 | ||
本发明涉及高通量测序生物信息领域,具体涉及一种可视化编辑小提琴图的生成方法及系统。通过获取绘制小提琴图实时请求数据;对获取到的实时请求数据进行解析处理;根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑小提琴图。可以实现操作人员在无需下载绘图软件和学习编程,只需要通过简单的操作,几分钟就能得到结果,这样大大节省了时间,提高了工作效率,同时用户可以自主进行横纵坐标的命名、自定义颜色、选择是否显示数据散点,充分体现了软件的人性化,这样便于画出的图形更加美观。得到的绘图结果便于用户去理解图片某些特殊位置代表的含义,也便于用户各取所需,全面满足需求。
技术领域
本发明涉及高通量测序生物信息领域,具体涉及一种可视化编辑小提琴图的生成方法及系统。
背景技术
高通量测序会产生海量的测序数据,如何从杂乱无章的数据中高效地提取出所关注的有价值的信息并且将相关数据进行可视化展示,使结果直观明了,便于理解。图表是“数据可视化”的常用手段,其中最为常用的是一些基本的图表如:柱状图、折线图、饼图等。在高通量测序生物信息分析中,数据可视化的表现形式非常广泛。例如,在研究多个基因的差异表达时,我们常会用火山图、热图、曼哈顿图等进行结果的统计与可视化。然而,在研究少数几个基因的差异表达时,常用箱线图、柱状图等。
箱形图是用来显示一组数据分散情况的统计图,能提供有关数据的位置和分散情况的关键信息,尤其在比较不同的母体数据时更能表现其差异。核密度图可以比较直观地看出数据样本本身的分布特征。
小提琴图是箱形图和核密度图的结合,用来显示数据分布及其概率密度。虽然小提琴图并不常见,但是,其在一些高分文章中经常出现。目前,人们常用R语言等编写代码来绘制小提琴图。对于有生信编程基础的人来说,绘制小提琴图来说几乎没有难度。然而,对于那些零编程基础的人来说,想利用小提琴图来进行数据可视化展示具有相当大的难度。就需要他们花费大量的时间去学习编程,不断地尝试摸索才能绘制出美观且高质量的小提琴图。如果对绘制出的图不满意时,需要重新更改代码重新绘制,这样具有费时费力,效率低下。
发明内容
针对无法实时编辑、时效性差和效率低下的技术问题,本发明提供一种可视化编辑小提琴图的生成方法、系统、平台及存储介质,实现可实时编辑,时效性好的目的。
本发明具体通过以下技术方案实现:
一种可视化编辑小提琴图的生成方法,所述的方法,具体包括如下步骤:
获取绘制小提琴图实时请求数据;
对获取到的实时请求数据进行解析处理;
根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑小提琴图。
进一步地,所述的实时请求数据包括:任务编号、数据文件和参数信息;
所述的数据文件格式为txt格式。
进一步地,于步骤获取绘制小提琴图实时请求数据中,还包括如下步骤:
对数据文件的格式进行判断,若符合格式要求,则执行下一步,否则重新获取数据文件。
进一步地,于步骤对获取到的实时请求数据进行解析处理中,还包括如下步骤:
利用任务编号和参数信息生成配置文件和绘图任务执行命令。
进一步地,于步骤根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑小提琴图中,还包括如下步骤:
获取数据文件;
对所述的数据文件进行统计;
生成结果数据文件;
相应地,于步骤根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑小提琴图中,还包括如下步骤:
获取结果数据文件和配置文件;
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