[发明专利]一种肠道菌群检测系统

权利要求书

1.一种肠道菌群的检测样本的采集装置，其特征在于，所述采集装置包括取样部件，及与取样部件可拆卸连接的收集部件；

所述取样部件包括主杆、活动管、联动杆、抓斗和密封盖，所述活动管套装在主杆外面且能够沿着主杆轴方向与主杆做相对运动，活动管的长度小于主杆长度，所述主杆上设置有限位机构，所述限位机构位于主杆上的活动管两侧，活动管的长度小于位于主杆上的活动管两侧的限位机构之间的距离，所述抓斗为两个互相配合的半壳性空腔体，抓斗的两个互相配合的半壳性空腔体的末端均转动连接于主杆一端，抓斗的两个互相配合的半壳性空腔体拼合时为中空壳体，中空壳体的顶端为锥形，抓斗的两个互相配合的半壳性空腔体分别通过两个联动杆与活动管相连接，联动杆一端转轴连接在活动管上，联动杆另一端转轴连接在抓斗的半壳性空腔体上，所述活动管外周固定有与活动管同轴的密封盖；

所述收集部件为不具有上开口的管状容器，收集部件的上开口与所述密封盖盖合，收集部件的上开口与密封盖盖合时，取样部件的联动杆和抓斗位于收集部件的管状容器内，收集部件的管状容器侧壁和密封盖上设置有注射针孔，所述注射针孔由注射针头可刺穿材料一体密封。

2.根据权利要求1所述的采集装置，其特征在于，所述注射针头可刺穿材料为橡胶、乳胶、硅胶或者锡箔纸。

3.根据权利要求1所述的采集装置，其特征在于，所述抓斗的一个半壳性空腔体边缘安装有橡胶密封环，抓斗的另一个半壳性空腔体边缘设置有橡胶密封槽，抓斗的两个互相配合的半壳性空腔体拼合时为弹头中空腔体。

4.根据权利要求1所述的采集装置，其特征在于，所述活动管滑动套装在主杆外面或者通过配合的螺纹套装在主杆外面。

5.根据权利要求1所述的采集装置，其特征在于，所述收集部件为不具有上开口的试管状容器。

6.根据权利要求1所述的采集装置，其特征在于，所述主杆顶端和活动管顶端设置有防滑橡胶垫，所述收集部件上端外侧设置有外螺纹，所述密封盖侧壁内侧设置有与所述外螺纹配合的内螺纹，收集部件的上开口通过配合的螺纹与密封盖盖合。

7.根据权利要求1所述的采集装置，其特征在于，所述限位机构为设置在主杆上的环状凸棱，所述环状凸棱的外径大于所述活动管的内径。

8.根据权利要求1所述的采集装置，其特征在于，所述主杆的长度为0.5-1m，主杆的外径为1-3cm，活动管的外径为3-5cm，抓斗的长度为2-5cm，抓斗拼合时的外径为2-5cm，收集部件的外径为5-10cm，收集部件的长度为8-15cm。

9.一种肠道菌群检测系统，其特征在于，所检测系统包括：

用于采集肠道菌群的检测样本的采集装置、检测样本预处理装置、样本检测装置、数据分析装置和结果显示装置；

所述检测样本的采集装置为如权利要求1-8任一所述的检测样本的采集装置；

检测样本预处理装置用于将所述采集装置采集到的检测样本进行预处理获取核酸样本；

所述样本检测装置用于将所述检测样本预处理装置获得的核酸样本进行16s rRNA扩增测序和鸟枪宏基因组测序获取核酸样本信息；

所述数据分析装置用于前处理分析和后处理分析，所述前处理分析包括将所述样本检测装置获取的核酸样本信息进行去噪声信号、数据拆分、双端read拼接、去接头、去嵌合体序列、调整低质量区域的处理；所述后处理分析包括OTU聚类分析、Alpha多样性分析和Beta多样性分析；

所述结果显示装置用于将数据分析装置获得的结果通过显示器或者打印装置显示给使用者。

10.根据权利要求9所述的系统，其特征在于，所述OTU聚类分析通过成分分析的菌群分类算法以及基于相似度分析的菌群分类算法，研究分析菌群的分层结构特征，统计每个样品在界、门、纲、目、科、属、种、株的分类水平上的序列数目；

所述Alpha多样性分析通过Chao1指数确定检测样本的物种丰富度，所述Alpha多样性分析通过香农-维纳指数确定检测样本的群落多样性；

所述Beta多样性分析包括主成分/主坐标分析、检测样本聚类分析和LEfSe分析，确定检测样本中的关键优势物种，并确定检测样本和和对照样本间的相异系数。