[发明专利]用于由经归一化生物标志物评分鉴定癌症治疗的系统和方法

权利要求书

1.系统，其包含：

至少一个计算机硬件处理器；

存储生物标志物信息的至少一个数据库；以及

存储处理器可执行指令的至少一个非暂时性计算机可读存储介质，所述处理器可执行指令当由所述至少一个计算机硬件处理器执行时使所述至少一个计算机硬件处理器执行：

获得关于对象的至少一个生物样品的测序数据；

在所述至少一个数据库中访问指示多种生物标志物的至少参考子集中每种生物标志物的值在相应人群中的分布的生物标志物信息，所述多种生物标志物中的每一种与多种治疗中的至少一种治疗相关；

使用所述测序数据和所述生物标志物信息来确定所述多种生物标志物的至少对象子集中每种生物标志物的经归一化评分，以获得所述对象的经归一化生物标志物评分集合，其中所述多种生物标志物的所述对象子集为所述多种生物标志物的所述参考子集的子集；以及

使用所述对象的所述经归一化生物标志物评分集合来确定所述多种治疗的治疗评分，所述治疗评分中的每一个指示所述对象对施用所述多种治疗中相应治疗的预测响应。

2.权利要求1所述的系统，其中所述多种生物标志物包含第一生物标志物，并且其中确定所述多种生物标志物的至少所述对象子集中每种生物标志物的经归一化评分包括：

使用所述第一生物标志物的值的分布确定所述第一生物标志物的第一经归一化评分。

3.权利要求2所述的系统，其中确定所述第一经归一化评分包括：

使用所述测序数据确定所述第一生物标志物的第一未经归一化评分；

基于所述第一生物标志物的值的第一分布确定第一Z评分；以及

基于所述第一未经归一化评分和所述第一Z评分确定所述第一生物标志物的所述第一经归一化评分。

4.权利要求1或任一其他前述权利要求所述的系统，其中确定所述多种治疗的治疗评分包括将所述多种治疗中第一治疗的第一治疗评分确定为所述对象的所述经归一化生物标志物评分集合中两个或更多个评分的总和。

5.权利要求1或任一其他前述权利要求所述的系统，其中确定所述多种治疗的治疗评分包括至少部分通过以下来确定所述多种治疗中第一治疗的第一治疗评分：

确定所述对象的所述经归一化生物标志物评分集合中两个或更多个评分的权重；以及

将所述第一治疗评分确定为所述两个或更多个评分的加权总和，所述总和的被加数通过所确定的权重进行加权。

6.权利要求5或任一其他前述权利要求所述的系统，其中确定所述权重包括使用统计模型来确定所述权重。

7.权利要求6或任一其他前述权利要求所述的系统，其中确定所述权重包括使用广义线性模型来确定所述权重。

8.权利要求6或任一其他前述权利要求所述的系统，其中确定所述权重包括使用逻辑斯谛回归模型来确定所述权重。

9.权利要求1或任一其他前述权利要求所述的系统，其中所述多种治疗包含第一治疗和不同于所述第一治疗的第二治疗，并且其中确定所述多种治疗的治疗评分包括：

使用所述对象的所述经归一化生物标志物评分集合的第一子集确定所述第一治疗的第一治疗评分；以及

使用所述对象的所述经归一化生物标志物评分集合的第二子集确定所述第二治疗的第二治疗评分，

其中所述第二子集不同于所述第一子集。

10.权利要求1或任一其他前述权利要求所述的系统，其中所述处理器可执行指令还使所述至少一个处理器执行：

向用户提供所确定的治疗评分。

11.权利要求1或任一其他前述权利要求所述的系统，其中所述处理器可执行指令还使所述至少一个处理器执行：

基于所确定的治疗评分对所述多种治疗进行排名。