[发明专利]序列检测系统的调整与校准特征在审

专利信息
申请号: 201880044242.7 申请日: 2018-09-14
公开(公告)号: CN111094540A 公开(公告)日: 2020-05-01
发明(设计)人: J·G·曼德尔;K·L·冈德森;M·G·基恩;E·C·加西亚 申请(专利权)人: 伊鲁米纳公司
主分类号: C12M1/36 分类号: C12M1/36;C12M1/34;C12Q1/6869
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 傅远
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 序列 检测 系统 调整 校准 特征
【权利要求书】:

1.一种序列检测系统,包括:

机械变化传感器,当所述机械变化传感器特别是与在目标内的实体交互时,所述机械变化传感器展示一个或多个机械变化,每种实体具有一类型;

机械变化至信号转换器,将所述一个或多个机械变化转换成信号;

分析子系统,使用所述信号确定在所述目标内的实体类型的序列;以及

控制子系统:

根据一个或多个操作参数初始化所述序列检测系统,以及

控制所述序列检测系统以生成所述信号、收集所述信号的样本、以及分析所述信号以确定在所述目标内的实体类型的所述序列。

2.根据权利要求1所述的序列检测系统,

其中所述目标是引物相关联的核酸模板聚合物;

其中所述实体是核苷酸单体;

其中所述机械变化传感器是在第一溶液容纳室内容纳的核酸聚合酶;以及

其中所述机械变化至信号转换器还包括:

可变电阻器,调节通过孔蛋白通道的电流的流动,所述孔蛋白通道提供在所述第一溶液容纳室和第二溶液容纳室之间的流体连通;

机械耦合器,将所述机械变化组件耦合到所述可变电阻器;以及

电流到电压转换器,输出电压信号,所述电压信号对应于通过所述孔蛋白通道的所述电流的流率而变化。

3.根据权利要求2所述的序列检测系统,其中所述操作参数包括:

读取电压的电压幅度和所述读取电压的极性,所述读取电压被施加在所述孔蛋白通道的两端;

噪声抑制电压的电压幅度和所述噪声抑制电压的极性,所述噪声抑制电压被施加在所述孔蛋白通道的两端;

配置电压的电压幅度和所述配置电压的极性,所述配置电压被施加在所述孔蛋白通道的两端。

4.根据权利要求3所述的序列检测系统,

其中所述噪声抑制电压的所述极性与所述读取电压的所述极性相反;以及

其中所述噪声抑制电压的所述极性与所述配置电压的所述极性相反。

5.根据权利要求3所述的序列检测系统,其中所述控制子系统通过以下配置所述序列检测系统:

利用所述配置极性将所述配置电压施加在述孔蛋白通道的两端,以在所述孔蛋白内安置所述核酸聚合酶机械变化传感器。

6.根据权利要求5所述的序列检测系统,其中,按照所述序列检测系统的配置,所述控制子系统调整所述读取电压幅度以在参考位移处定位所述核酸聚合物系链的所述报告者区域。

7.根据权利要求3所述的序列检测系统,其中,按照所述序列检测系统的配置,所述控制子系统控制所述序列检测系统通过以下方式生成所述信号、收集所述信号的样本、以及分析所述信号以确定在所述目标内的实体类型的所述序列:

迭代地如下执行,直到终止条件发生为止:

利用所述读取电压的所述极性,将所述读取电压施加在所述孔蛋白通道的两端达第一时间段,在所述第一时间段期间,所述电压输出信号由所述分析子系统采样、存储在存储器中、并且分析;以及

利用所述噪声抑制电压的所述极性,将所述噪声抑制电压施加在所述孔蛋白通道的两端达第二时间段。

8.根据权利要求7所述的序列检测系统,其中所述第一时间段和所述第二时间段的所述长度由操作参数指定。

9.根据权利要求7所述的序列检测系统,其中所述终止条件包括:

断电事件;以及

所述序列检测系统的序列信息的生成率降低到阈值等级以下。

10.根据权利要求2所述的序列检测系统,其中所述操作参数包括:

温度;

在所述第一溶液容纳室和所述第二溶液容纳室中的所述溶液的pH;以及

在所述第一溶液容纳室和所述第二溶液容纳室中的所述溶液中的成分。

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