[发明专利]用于鉴别并治疗白血病中对于CTA4拮抗剂的耐药性的组合物和方法在审

专利信息
申请号: 201880043129.7 申请日: 2018-06-26
公开(公告)号: CN110799544A 公开(公告)日: 2020-02-14
发明(设计)人: P·巴切莱迪 申请(专利权)人: 达纳-法伯癌症研究所有限公司
主分类号: C07K16/28 分类号: C07K16/28;C12Q1/6886;A61P35/02
代理公司: 11314 北京戈程知识产权代理有限公司 代理人: 程伟
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 耐药性 白血病 鉴别 拮抗剂 单抗 治疗
【权利要求书】:

1.一种确定使用细胞毒T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)拮抗剂治疗患有白血病的受试者是否将导致所述受试者的临床受益的方法,所述方法包含:

从患有白血病的受试者获得测试样本;

测定所述测试样本中至少一种白血病相关基因的表达水平;

将所述测试样本中所述白血病相关基因的所述表达水平与参考样本中所述白血病相关基因的表达水平比较;以及

确定如果所述测试样本中所述白血病相关基因的所述表达水平相对于所述参考样本中所述白血病相关基因的所述水平表达上有差异,所述CTLA4拮抗剂是否将抑制所述受试者的白血病。

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述测试样本从白血病组织、肿瘤微环境或肿瘤浸润免疫细胞获得。

3.根据权利要求1所述的方法,其中所述受试者体内的临床受益包含通过实体肿瘤的疗效评估标准(RECIST)界定的完全或部分应答;通过RECIST界定的病情稳定;或无论疾病级数或通过irRC标准界定的应答为何仍长期存活。

4.根据权利要求1所述的方法,其中所述测试样本从所述白血病获得,其中所述白血病相关基因包含CD47分子(CD47)基因;以及

确定如果所述测试样本中所述CD47基因的表达水平高于所述参考样本中所述CD47基因的水平,使用所述CTLA4拮抗剂治疗患有白血病的所述受试者将在所述受试者体内导致临床受益。

5.根据权利要求1所述的方法,其中所述测试样本从所述白血病获得,其中所述白血病相关基因包含CD47分子(CD47)基因;以及

确定如果所述测试样本中所述CD47基因的表达水平等于或低于所述参考样本中所述CD47基因的水平,使用所述CTLA4拮抗剂治疗患有白血病的所述受试者将不在所述受试者体内导致临床受益。

6.根据权利要求1所述的方法,其中所述样本包含脱氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)。

7.根据权利要求1所述的方法,其中所述样本包含血浆样本、血液样本、骨髓样本、淋巴结、或白血病感染的任何部位。

8.根据权利要求1所述的方法,其中所述样本包含循环肿瘤细胞。

9.根据权利要求1所述的方法,其中所述参考样本是从健康的正常组织、接受来自CTLA4拮抗剂的临床受益的白血病、或未接受来自CTLA4拮抗剂的临床受益的白血病获得的。

10.根据权利要求1所述的方法,其中经由Affymetrix基因芯片杂交、下一代测序、核糖核酸测序(RNA-seq)、实时逆转录酶聚合酶链反应(实时RT-PCR)分析、免疫组化(IHC)、免疫荧光、或甲基化特异性PCR来检测所述白血病相关基因的表达水平。

11.根据权利要求1所述的方法,其中经由RNA-seq检测所述白血病相关基因的所述表达水平,且所述参考样本是从来自与所述测试样本相同个体的健康正常组织或来自不同个体的一个或多个健康正常组织获得。

12.根据权利要求1所述的方法,其中经由RT-PCR检测所述白血病相关基因的所述表达水平,且所述参考样本是从与所述测试样本相同的个体获得。

13.根据权利要求1所述的方法,其中所述受试者是人类。

14.根据权利要求1所述的方法,还包括以化疗剂、放射疗法、冷冻疗法、激素疗法或免疫疗法治疗所述受试者。

15.根据权利要求14所述的方法,其中所述化疗剂包含达卡巴嗪、替莫唑胺、nab-紫杉醇、紫杉醇、顺铂或卡铂。

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