[发明专利]用于优化癌症治疗方案的SLFN11蛋白的量化在审
| 申请号： | 201880041578.8 | 申请日： | 2018-06-20 |
| 公开（公告）号： | CN110891579A | 公开（公告）日： | 2020-03-17 |
| 发明（设计）人： | 法比奥拉·切基;S·施瓦兹;托德·哈姆布拉夫;C·M·鲁丁;J·T·普瓦里耶 | 申请（专利权）人： | 南坦生物组学有限责任公司;纪念斯隆-凯特林癌症中心 |
| 主分类号： | A61K33/243 | 分类号： | A61K33/243;A61P35/00;B01D59/44;C12Q1/37;G01N33/00;G01N33/574;G01N33/566 |
| 代理公司： | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人： | 刘依云;乔雪微 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 优化 癌症 治疗 方案 slfn11 蛋白 量化 | ||
1.一种治疗肺癌患者的方法，包括：
(a)通过质谱法，量化取自患者的肿瘤样本制备而成的蛋白消化物中特定的SLFN11片段肽的水平，并计算样本中所述SLFN11片段肽的水平；
(b)将所述SLFN11片段肽的水平与参照水平进行对比；
(c)当所述SLFN11片段肽的水平高于所述参照水平时，使用包含有效量的铂基药剂的治疗方案治疗患者；和
(d)当所述SLFN11片段肽的水平低于所述参照水平时，使用不包含有效量的铂基药剂的治疗方案治疗患者。
2.根据权利要求1所述的方法，其中，步骤(c)中的治疗方案还包含紫杉醇。
3.根据权利要求1所述的方法，其中，所述SLFN11片段肽的参照水平为100amol/μg,+/-95amol/μg所分析的生物样本蛋白。
4.根据权利要求1所述的方法，其中，所述参照水平为100amol/μg,+/-75amol/μg所分析的生物样本蛋白。
5.根据权利要求1所述的方法，其中，所述参照水平为100amol/μg,+/-50amol/μg所分析的生物样本蛋白。
6.根据权利要求1所述的方法，其中，所述参照水平为100amol/μg,+/-25amol/μg所分析的生物样本蛋白。
7.根据前述的任意一项权利要求所述的方法，其中，所述生物样本的所述蛋白消化物是用Liquid Tissue方法制备的。
8.根据前述的任意一项权利要求所述的方法，其中，所述蛋白消化物包括蛋白酶消化物。
9.根据权利要求7所述的方法，其中，所述蛋白消化物包括胰蛋白酶消化物。
10.根据前述的任意一项权利要求所述的方法，其中，所述质谱法包括串联质谱法、离子阱质谱法、三重四极杆质谱法、MALDI-TOF质谱法、MALDI质谱法、混合离子阱/四极杆质谱法和/或飞行时间质谱法。
11.根据权利要求10所述的方法，其中，所使用的质谱法的模式为选择反应监测(SRM)、多重反应监测(MRM)、平行反应监测(PRM)、智能选择反应监测(iSRM)和/或多重选择反应监测(mSRM)。
12.根据前述的任意一项权利要求所述的方法，其中，特定的SLFN11肽具有如YTPESLWR(SEQ ID NO:1)所示的氨基酸序列。
13.根据前述的任意一项权利要求所述的方法，其中，所述肿瘤样本是细胞、细胞集合或固体组织。
14.根据权利要求13所述的方法，其中，所述肿瘤样本是福尔马林固定的固体组织。
15.根据权利要求14所述的方法，其中，所述组织是石蜡包埋的组织。
16.根据前述的任意一项权利要求所述的方法，其中，所述量化特定的SLFN11片段肽包括通过与已知量的加标内标肽进行对比，来确定所述样本中SLFN11肽的量，其中，生物样本中的天然肽和内标肽都对应于相同的SLFN11片段肽的氨基酸序列YTPESLWR(SEQ ID NO:1)。
17.根据权利要求16所述的方法，其中，所述内标肽是同位素标记的肽。
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