[发明专利]工程化细菌和使用方法

说明书

本发明提供了包含从哺乳动物受试者的微生物组样品中分离并经工程化以表达异源多核苷酸的共生细菌群的组合物，包含这样的工程化的共生细菌的组合物以及用于例如通过施用所述工程化的共生/原生细菌向哺乳动物递送治疗性多肽的方法。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2017年4月17日提交的美国临时申请62/486,068的基于35U.S.C.§119(e)的权益，出于所有目的，通过引用以其整体明确并入本文。

政府支持声明

这项工作部分地得到美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)的拨款R03DK114536和1K08DK10290201A1号支持。政府在本发明中享有某些权利。

背景技术

测序、质谱和生物信息技术的最新进展促进了我们对微生物组(microbiome)在宿主生理过程中的作用的理解，这些生理过程包括但不限于代谢、炎症、行为和神经系统疾病(Vuong等，Annu Rev Neurosci.(2017)40：21-49)[也引用25271724]。尽管将生理过程与微生物组联系起来在概念上令人兴奋，但该领域仍处于萌芽状态；研究显示出很强的关联性，但几乎尚未显示出微生物群与各种生理过程之间存在明显的机制性关系。例如，由肠道微生物组调节的分析物的绝对数量以及来自肠道上皮的信号传导分子使得难以鉴定可能有助于神经行为过程的微生物组功能。为了发展更好的机制理解和更有效的微生物组介导的疗法，必须采用强调肠道微生物组功能性调节的不同方法。

发明内容

在一方面，提供了将治疗性多肽递送至需要其的哺乳动物受试者的方法。在某些实施方式中，所述方法包括：

a)从供体受试者获得包含细菌细胞的微生物组样品；

b)从微生物组样品中分离细菌细胞，其中，分离的细菌细胞来自供体受试者共生(commensal)/原生(native)的细菌菌株；

c)将分离的细菌细胞体外培养以产生基本上同质的分离和培养的细菌细胞群；

d)用与细菌和/或供体受试者异源的一种或多种多核苷酸转化基本上同质的细胞群，其中，所述一种或多种多核苷酸编码一种或多种治疗性多肽；和