[发明专利]一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法

权利要求书

1.一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，其特征在于，

提取一级警示结构：

基于PubChem fingerprint分子指纹库，利用子结构频率分析和子结构占比分析提取活性数据化合物的一级警示结构；

提取二级警示结构：

利用SARpy软件对满足一级警示结构的化合物进行二级警示结构的提取；

提取三级警示结构：

利用SARpy软件对同时满足一级警示结构和二级警示结构的化合物进行三级警示结构的提取；

将一级警示结构和二级警示结构组合构成活性预测模块，在预测模块中先筛查出存在特征结构的化合物，再基于二级警示结构筛查出具有潜在内分泌干扰作用的警示化合物；将三级警示结构作为干扰活性预测模块，而后再基于干扰活性预测模块筛查干扰活性。

2.根据权利要求1所述的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，其特征在于，提取一级警示结构之前还包括步骤：活性数据的收集，从公开数据库中将具有竞争结合实验，报告基因实验和细胞毒性实验的三种体外实验数据的化合物进行收集，并得到活性数据。

3.根据权利要求1所述的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，其特征在于，提取一级警示结构的具体方法如下：

1)计算化合物的PubChem fingerprints子结构，

2)利用进行子结构频率分析，

3)再利用进行子结构占比分析；并通过R语言的pheatmap算法得到一级警示结构；

其中上述的

含有PubChem fingerprints子结构的活性化合物数；

N_total：整个数据集化合物的总数；

N_{fragment_total}：含有PubChem fingerprints子结构的化合物总数；

N_A：数据集中活性化合物的总数；

含有PubChem fingerprints子结构的非活性化合物总数；

N_I数据集中非活性化合物的总数。

4.根据权利要求1所述的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，其特征在于，提取一级警示结构后将满足一级警示结构的化合物进行分类，具体分类方法是：将含有极性原子和芳香环键的一级警示结构作为Type 1；再将只含有极性原子而不存在芳香环键作为Type 2；最后将任意碳链作为Type 3。

5.根据权利要求1所述的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，其特征在于，提取三级警示结构的具体方法是：

1)将同时满足一级警示结构和二级警示结构的化合物根据干扰活性分为拟性干扰物、抗性干扰物、又拟又抗干扰物；

2)利用SARpy软件分析得到活性化合物所含有的二级警示结构信息，通过R语言进行聚类分析，再根据热图分析，将唯一存在于某一种干扰活性条件下的化合物的特征二级警示结构设定为三级警示结构；

3)针对特征二级警示结构无法区分的活性化合物，利用SARpy软件进行相关特征三级警示结构的提取三级警示结构；核受体介导内分泌干扰物的三级警示结构提取完毕。

6.根据权利要求2所述的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，其特征在于，活性数据的收集和提取一级警示结构之间还包括步骤：化合物的活性分类

基于得到的活性数据，将化合物分为活性、非活性、拟性、又拟又抗和抗性五类。

7.根据权利要求2所述的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，其特征在于，活性数据的收集选取的实验都需是人类细胞实验。