[发明专利]一种自动化的检测报告生成方法

说明书

本发明公开了一种自动化的检测报告生成方法，其特征在于，包括如下步骤：用户访问服务器，登陆index.html界面；选择样本信息文件和/或检测结果文件；服务器main.go读取文件保存至服务器，设置参数，调用后台auto_med_report.py，读取文件信息，生成报告；所述服务器返回报告生成结果及报告路径至所述index.html界面，生成最终供下载分析的报告。使用本方法，报告人员仅需通过网页浏览器访问服务器，通过可视化网页界面，上传符合要求的相应文件，一次运行即可获得多个样本对应的最终检测报告，操作简单，极大提升了工作效率，避免了人工输入错误，缩短了项目周期。

技术领域

本发明涉及基因测序领域，具体涉及一种自动化的检测报告生成方法。

背景技术

早期的检测报告生成是由报告人员手动将受测者信息、检测结果及代谢能力风险填入报告模板中，效率较低，容易出错，增加了人力成本。本方法的主要用途是能够自动化、批量化地根据检测结果信息帮助报告使用者进行判断和建议，并整合样本信息，最终生成完整的检测报告。

发明内容

为了克服现有技术存在的上述缺陷，本发明的目的在于提供一种自动化的检测报告生成方法。

为了实现本发明的目的，所采用的技术方案是：

一种自动化的检测报告生成方法，包括如下步骤：

用户访问服务器，登陆index.html界面；

选择样本信息文件和/或检测结果文件；

服务器main.go读取文件保存至服务器，设置参数，调用后台auto_med_report.py，读取文件信息，生成报告；

所述服务器返回报告生成结果及报告路径至所述index.html界面，生成最终供下载分析的报告。

一种自动化的检测报告生成方法，具体而言，包括如下步骤：

登陆账号后，将目标数据上传服务器，以命令：cd/report进入报告路径；

使用脚本：./med_auto_report_v1.6.py-i input/Sample_inf o_2018.06.13.xlsx-r input/folate_20180913.xlsx处理输入信息，输出报告；

输出目录：/report/auto_report_out，生成报告文件夹并自动导出。

在本发明的一个优选实施例中，所述选择样本信息文件和/或检测结果文件包括检测对象的叶酸水平数据和/或钙水平数据。

在本发明的一个优选实施例中，所述的叶酸水平数据包括从“叶酸检测记录单-(日期).xlsx”中读取对应样本的MTHFR、MTRR、SLC19A1、MTHFR_S2四个检测位点的变异信息和/或判定结果。

在本发明的一个优选实施例中，所述的钙水平数据包括从“孕妇钙检测记录单-(日期).xlsx”中读取对应样本的ESR1-S2、VDR-S3、VDR-S2、VDR-S1和ESR1-S1五个检测位点的变异信息和/或判定结果。

本发明的有益效果在于：

使用本方法，报告人员仅需通过网页浏览器访问服务器，通过可视化网页界面，上传符合要求的相应文件，一次运行即可获得多个样本对应的最终检测报告，操作简单，极大提升了工作效率，避免了人工输入错误，缩短了项目周期。

附图说明

图1为本发明的流程示意图。

图2为实施例1、2的流程示意图。

图3为本发明生成的钙检测报告中的样本信息和检测结果示意图。