[发明专利]癌症的预后和诊断方法

说明书

本发明涉及癌症的预后和诊断方法。提供了通过检测来自患者的样品中癌症的生物标志物的存在和/或量而诊断患者中的癌症的方法。所述方法和生物标志物可以用于开发对于具有癌症或怀疑具有癌症的患者的精确预后，或者精确地诊断具有癌症或怀疑具有癌症的患者。所述方法和生物标志物可以用于将患者鉴定和/或分类为用于癌症治疗的候选。

本申请是申请日为2013年8月13日的中国专利申请201380051263.9“癌症的预后和诊断方法”的分案申请。

本申请要求2012年8月13日申请的美国临时申请号61/682,462的优先权，所述申请以其整体通过引用并入本文。

技术领域

本公开涉及用于通过检测患者中的生物标志物以及测定其量来确定患者中癌症的预后、诊断或风险鉴定的方法和免疫测定平台。生物标志物可以用于鉴定具有癌症的患者，鉴定患者作为癌症治疗的候选，分类患者发生癌症的风险，或分类患者的癌症阶段或癌症进展的风险，以及确定诊断、预后或治疗方案。

背景技术

癌症仍然是发达国家中成人的发病率和死亡率的一个显著原因。在一些情况下，癌症治疗的改善已经能够增加患者从诊断到死亡的存活时间。然而，癌症治疗的总体成功经常取决于疾病的早期检测，这允许治疗在原发性肿瘤扩展和/或转移性生长发生之前开始。因此，提供癌症的早期和/或更准确诊断的方法和测定是期望的，因为此类方法和测定可以允许早期治疗干预，并且可以改善患者后果(例如，生活质量，生存预期等)。

层粘连蛋白是在基底层中发现的一组异源三聚体蛋白，并且形成基底膜的部分。这些蛋白基于三种不同的多肽分类，所述不同的多肽与彼此复合以形成层粘连蛋白结构。这三种多肽被鉴定为alpha (α)链、beta (β)链和gamma (γ)链，并且各自具有几个分子种类(例如，α1-α5、β1-β3和γ1-γ2)。层粘连蛋白5(或LN5)已知存在于基底层，且在位于上皮细胞和支持上皮细胞的结缔组织之间的基底膜中是丰富的。LN5的结构在已知层粘连蛋白中是独特的，因为它是具有包括gamma-2 (γ2)链的结构的唯一的层粘连蛋白，其当与α3链和β3链复合时形成LN5。在生理上，LN5已知由上皮细胞产生，并且可以促进细胞粘附、增殖、分化和/或迁移。例如，当LN5从上皮细胞分泌时，它易受蛋白酶降解(例如，由膜-1型基质金属蛋白酶-1 (MT1-MMP))。在一些情况下，LN5朝着γ-2链序列的N末端处理，以生成具有EGF样活性(包括促进细胞迁移和侵袭)的片段[Koshikawa, 等人, J. Cell Biol., (2000)148:615-624]。

用于检测LN5(包括其加工形式)的现有方法主要聚焦于组织学方法(例如，组织的免疫染色)、尿分析或蛋白水解片段(例如，N末端片段)的检测，并且没有提供用于检测层粘连蛋白γ-2单体的便利和/或灵敏的方法。

发明内容

在一个方面，本公开提供了用于为具有癌症或处于具有癌症的风险中的主体提供诊断、预后或风险分类的方法，所述方法包括以下步骤：从所述主体获得包含血液的生物样品；测定来自主体的生物样品中层粘连蛋白γ-2单体的浓度；将来自样品的层粘连蛋白γ-2单体浓度与参考层粘连蛋白γ-2单体浓度值进行比较，其中样品中的层粘连蛋白γ-2单体浓度大于参考层粘连蛋白γ-2单体浓度值将所述主体鉴定为具有癌症或者具有发生癌症的增加风险。

在一个方面，本公开涉及用于为具有癌症或处于具有癌症的风险中的主体提供诊断、预后或风险分类的方法，所述方法包括以下步骤：从所述主体获得包含血液的生物样品；测定来自主体的生物样品中层粘连蛋白γ-2单体的浓度；和提供层粘连蛋白γ-2单体的浓度，以便当与参考层粘连蛋白γ-2单体浓度值相比时将所述主体鉴定为具有癌症或者具有发生癌症的增加风险。