[发明专利]利用基质辅助激光解吸/离子化飞行时间质谱仪进行分类数据操控

说明书

涉及方法、系统、设备和/或计算机程序。质谱仪测试数据(例如，医疗患者的血液样本)可与元数据信息关联。关联的元数据信息可与医疗患者关联。样本参考库的子组可基于关联元数据信息。根据实施例，样本参考库可包含多组质谱仪参考数据。实施例将质谱仪测试数据与所选的样本参考库的子组的质谱仪参考数据进行匹配。实施例基于匹配的质谱仪参考数据的已知特征确定质谱仪测试数据的源(例如，医疗患者)的特征信息。

相关申请的交叉引用

本申请要求2016年8月22日提交的第62/377,768号美国临时专利申请的优先权，其全部内容兹通过引用并入本案。

背景技术

生物标志物是存在于血液、其他体液或组织中的生物分子，其是病症和/或疾病的正常过程或异常过程的标志。例如，糖蛋白CA-125是可指示存在癌症的生物标志物。因此，可以测量并且评估生物标志物，以认定特定疾病的存在或进展或者观察身体对疾病或病症的治疗的反应好不好。生物标志物在蛋白质、肽、脂质、聚糖和/或代谢物中的存在和/或其数量水平的变化可由质谱仪测量。

在众多类型的质谱仪中，基质辅助激光解吸/离子化飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)是采用软离子化技术的分析工具。样本可埋置于基质中，并且可以对基质发射激光脉冲。基质吸收激光能量，并且基质的分子发生离子化。然后，电场使离子化分子加速通过真空管的一部分，并且然后，离子化分子在室内没有电场的其余地方飞行。测量飞行时间，以产生质荷比(m/z)。MALDI-TOF MS以非常高的准确性和亚皮摩尔(subpicomole)灵敏度提供对诸如肽、蛋白质、和大有机分子的生物分子的快速认定。MALDI-TOF MS可在实验室环境下用于快速并且准确地分析生物分子并将其应用扩展到临床领域，诸如微生物检测和诸如癌症的疾病诊断。

在为了高效并且/或者有效地表征测试样本而将测试样本与参考数据进行比较时，可能产生复杂化的问题。例如，根据实施例，测试样本的高效和/或有效表征可显著改善基质辅助激光解吸/离子化飞行时间质谱仪的效用。

发明内容

实施例涉及方法、系统、设备和/或计算机程序。质谱仪测试数据(例如，医疗患者的血液样本)可与元数据信息关联。关联的元数据信息可与医疗患者关联。实施例可基于关联的元数据信息选择样本参考库的子组。根据实施例，样本参考库可包含多组质谱仪参考数据。实施例可将质谱仪测试数据与所选样本参考库的子组的多组质谱仪参考数据中的至少一组进行匹配。实施例可基于匹配的质谱仪参考数据的已知特征确定质谱仪测试数据的源(例如，医疗患者)的特征信息。

质谱仪测试数据可包含质谱仪的质荷比布型输出。多组质谱仪参考数据包括存储于样本参考库中的参考样本的多个质荷比布型。匹配包括将质谱仪测试数据的质荷比布型与参考样本的多个质荷比布型进行比较。

实施例涉及参考数据样本的归类和/或分类。实施例可改善认定和/或诊断准确性，因为每个类和/或归类以相似特征聚类，以使聚类统计学上互相独立。在实施例中，聚类可将测试样本与其优化类参考数据匹配和/或比较，以有效并且/或者高效地表征测试样本。

附图说明

示例性图1是根据实施例的疾病诊断实验室的布置，其中样本处理单元、MALDI-TOF MS单元和诊断单元分别位于三个不同系统。

示例性图2是根据实施例的系统图，包含集成到一个系统中的样本处理单元、MALDI-TOF MS单元和诊断单元。

示例性图3是根据实施例的集成系统的系统图，包含在一个系统中的样本处理单元、MALDI-TOF MS单元和诊断单元。

示例性图4是根据实施例的集成诊断系统的系统图，包含集成于一个系统中的样本处理单元和MALDI-TOF MS单元，而诊断单元作为独立单元提供。

示例性图5根据实施例的MALDI-TOF MS单元的示意图，其中部件是模块形式。