[发明专利]抗原偶联的杂交试剂

说明书

本公开提供用于各种杂交测定和其他相关技术的高效杂交试剂。杂交试剂包含寡核苷酸探针和桥接抗原，其中桥接抗原被可检测的抗体以高亲和力识别。本公开还提供了包含特异于多种不同靶核酸的杂交试剂组的组合物和包含杂交试剂对及其互补的可检测的抗体的组合物。成对的杂交试剂和可检测的抗体可用于各种杂交测定，特别是在高度多重测定中，其中桥接抗原的结构随着可检测的抗体的变化而相应变化，从而提供了多重杂交试剂，其能够在单次测定中同时检测多重靶核酸。本公开还提供了包含杂交试剂的试剂盒，使用本公开的杂交试剂的杂交测定方法和杂交试剂的制备方法。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2016年7月18日提交的美国临时申请No.62/363,825的权益，其全部的公开内容通过引用并入本文。

背景技术

在具有高灵敏度和特异性的细胞测定中，在低于皮克水平的一些情况下检测低表达靶标标志物(包括蛋白质和核酸)的能力仍然是未满足的需求。随着可用于分析的细胞和组织的样品尺寸变得越来越小，这种方法变得更加重要。此外，在单次测定中同时检测多种低表达靶标的能力将是进一步的益处。

原位杂交(ISH)是用于检测生物样品中的核酸的强大的标记技术。一般方法通常涉及使用与固定组织或细胞样品中的目的靶核酸互补的标记的DNA、RNA或修饰的核酸探针。标记的探针与样品中的靶标DNA或RNA序列杂交，从而提供关于一个或多个遗传基因座(例如，用于基因组DNA靶标)或一个或多个表达基因(例如，用于RNA靶标)的时间和空间信息。

可以根据用于修饰探针的标记的类型以及因此用于鉴定靶标的检测方法将原位杂交技术彼此区分。对于显色原位杂交(CISH)测定，使用过氧化物酶或碱性磷酸酶反应(如IHC染色中常规使用的反应和标记)在靶标位置处产生显色信号。随后使用明视场显微镜观察信号。CISH可用于测定(例如)基因扩增、基因缺失、染色体易位和染色体数目。CISH尤其适用于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的组织、中期染色体分散、固定细胞和血液或骨髓涂片。

对于荧光原位杂交(FISH)测定，荧光标记用于检测过程，并且使用荧光显微术或相关光谱技术检测信号。使用具有光谱上不同的荧光特性的多个荧光标记使得能够在单个样品内同时检测和共定位多个核酸靶标。因此，对于DNA靶标，FISH可用于(例如)检测目的基因组基因座的存在、拷贝数和位置，并鉴定基因突变体和染色体缺陷。对于RNA靶标，FISH可用于(例如)在时间和空间上评估基因表达，从而提供对生理过程和疾病发病机理的见解。

原位杂交技术可另外与免疫组织化学(IHC)染色技术组合使用，以同时标记在组织样品中或在另一合适表面上的靶核酸和表达靶标蛋白。

然而，尽管上述方法是有用的，但是仍然需要开发改进的杂交测定试剂、方法和试剂盒，其在单次测定中更灵敏、更具特异性、能够检测更多种核酸靶标。

发明内容

本公开通过在一个方面中提供了在各种杂交测定中发现有用的杂交试剂组合物来解决了这些和其他需要。具体而言，根据本发明的该方面，所述杂交试剂组合物包含：

与桥接抗原偶联的寡核苷酸探针；和

可检测的抗体；

其中所述可检测的抗体对所述桥接抗原具有高亲和力特异性。

在一些实施方案中，桥接抗原是肽或小分子半抗原。

在一些实施方案中，桥接抗原包含多个抗原决定簇。在具体实施方案中，多个抗原决定簇中的每个抗原决定簇是相同的。在其他具体实施方案中，多个抗原决定簇包含线性重复结构。更具体而言，线性重复结构是线性重复肽结构。

在其他具体实施方案中，多个抗原决定簇包括至少三个抗原决定簇，或者桥接抗原包括支化结构。

在一些实施方案中，桥接抗原是包含非天然残基的肽。具体而言，非天然残基可以是非天然立体异构体或β-氨基酸。