[实用新型]检测装置和测序系统

说明书

技术领域

本公开内容的实施方案总体上涉及例如在核酸测序操作中用于样品的流体操作和光学检测的装置和方法。

背景技术

我们的基因组提供了用于预测许多我们的固有倾向诸如我们的偏好、才能、对疾病的易感性和对治疗药物的反应性的蓝图。单独的人基因组包含超过30亿个核苷酸的序列。那些核苷酸中的仅一小部分的差异赋予我们许多独特的性质。研究团体在揭开组成蓝图的特征方面取得了令人印象深刻的进展，并且随之而来的，对每个蓝图中的信息与人类健康如何相关有了更完整的了解。但是，我们的了解还远远没有完成，这阻碍了信息从研究实验室向临床的移动，希望有一天我们每个人都将拥有我们个人基因组的拷贝，这样我们就可以和医生一起确定健康生活方式或恰当的治疗过程的合适选择。

目前的瓶颈是通量和规模的问题。揭开任一个给定个体的蓝图的基本组成部分是确定他们的基因组中30亿个核苷酸的确切序列。存在可用的技术，但那些技术通常需要数天和成千上万美元来执行。另外，任何个体的基因组序列的临床相关性是比较他们的基因组序列的独特性质(即他们的基因型)和与已知性质(即表型)相关的参考基因组。当人们考虑到，参考基因组是基于来自于通常使用上千名个体以统计学上有效的调查研究的基因型和表型的对应关系产生的时，规模和通量的问题变得明显。因此，最终可以为上千名个体进行数以十亿计的核苷酸测序以鉴定任何临床上相关的基因型与表型的对应。再乘以疾病的数量、药物反应性和其他临床上相关的性质，对非常廉价和快速的测序技术的需求变得更明显。

实用新型内容

需要降低测序的成本，这推动研究科学家进行大规模遗传相关性研究并使得测序可以在临床环境下获得，用于做出改变人生的决定的单个患者的治疗。本文列出的本实用新型的实施方案满足此需求并且还提供其他优点。

本公开内容的实施方案涉及以下方面：

1)本文提供了一种检测装置，所述装置包括具有物镜、激发辐射源和检测器的显微荧光计。显微荧光计被配置用于宽场图像检测。检测装置还包括流体系统，用于从试剂仓匣(cartridge receptacle)向流动池(flow cell) 递送试剂。流体系统包括具有多个流体通道的歧管主体，所述流体通道被配置用于试剂仓匣和流动池的入口之间的流体连通。流体系统还包括多个试剂吸取器(reagent sipper)，所述试剂吸取器从歧管主体端口向下延伸。每个试剂吸取器被配置为被置于试剂仓匣的试剂库(reagent reservoir)中，这样液体试剂可以从试剂库被吸入到试剂吸取器中。流体系统还包括阀，所述阀被配置为调节试剂库和流动池的入口之间的流体连通。流体通道将试剂吸取器流体连接至阀。检测装置还包括具有用于容纳流动池的夹持盖的流动池闩锁夹持模块(flow cell latch clamp module)。物镜被配置为将来自辐射源的激发辐射导向流动池和将来自流动池的发射导向检测器。显微荧光计是可移动的以获得流动池内表面的不同区域的宽场图像。

2)如1)所述的检测装置，其中所述检测装置包括不超过一个显微荧光计。

3)如1)或2)所述的检测装置，其中所述显微荧光计包括分光镜，所述分光镜被定位为将来自所述激发辐射源的激发辐射导向所述物镜和将来自所述物镜的发射辐射导向所述检测器。

4)如1)-3)中任一项所述的检测装置，其中所述显微荧光计是具有紧凑的落射荧光检测配置的集成的显微荧光计。

5)如1)-4)中任一项所述的检测装置，其中所述显微荧光计是可移动的以允许将比所述显微荧光计的视场更大的流动池成像。

6)如1)-5)中任一项所述的检测装置，所述检测装置还包括外罩和在所述外罩的正面展示的屏幕，所述屏幕充当图形用户界面。

7)如1)-5)中任一项所述的检测装置，所述检测装置还包括具有用于接收所述试剂仓匣的仓匣容器的外罩。

8)如1)-7)中任一项所述的检测装置，所述检测装置还包括流体自动化模块，所述流体自动化模块包括用于使所述试剂仓匣升高和降低的升降组件。

9)如1)-7)中任一项所述的检测装置，所述检测装置还包括流体自动化模块，所述流体自动化模块包括在装载期间移动所述试剂仓匣的传送带组件。

10)如1)-7)中任一项所述的检测装置，所述检测装置还包括流体自动化模块，所述流体自动化模块包括用于使所述试剂仓匣升高和降低的升降组件和在装载期间移动所述试剂仓匣的传送带组件。