[发明专利]数据处理方法及装置有效
申请号: | 201711455784.7 | 申请日: | 2017-12-27 |
公开(公告)号: | CN108346468B | 公开(公告)日: | 2021-03-23 |
发明(设计)人: | 张静波;王见收;刘珂弟;刘倩;唐宇 | 申请(专利权)人: | 北京科迅生物技术有限公司 |
主分类号: | G16H50/30 | 分类号: | G16H50/30 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 赵囡囡 |
地址: | 100037 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 数据处理 方法 装置 | ||
1.一种数据处理方法,其特征在于,包括:
获取受检者与目标疾病相关的至少一个位点的基因型的集合;
根据每个位点的基因型对应的优势比OR的值计算所述受检者罹患所述目标疾病的基因型风险概率;
获取所述受检者的外界因素集,其中,所述外界因素集包括与所述目标疾病相关的至少一个人体特征的值;
根据每个人体特征的值计算所述受检者罹患所述目标疾病的环境风险概率;
根据所述基因型风险概率和所述环境风险概率计算所述受检者罹患所述目标疾病的综合风险概率,
根据每个位点的基因型对应的优势比OR的值计算所述受检者罹患所述目标疾病的基因型风险概率包括:
获取第i个位点的基因型对应的OR值OR(m,i),其中,m∈(AA,Aa,aa),AA代表纯合型变异,Aa代表杂合型变异,aa代表野生型变异;
获取样本中的人群频率AFm;
通过以下公式对每个位点的基因型对应的OR值进行校正,得到第i个位点的基因型对应的校正后的OR值
通过以下公式计算所述至少一个位点的联合OR值ORG:
其中,n为所述至少一个位点的个数;
通过以下公式计算在所述受检者的基因型集为G的情况下罹患所述目标疾病D的基因型风险概率Pr(D|G):
ORG=odds(D|G)/odds(D),其中,odds(X)=Pr(X)/[1-Pr(X)],
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,获取所述受检者的外界因素集包括:
获取每个人体特征的信息熵,其中,所述信息熵指示人体的外界影响因素参数;
基于信息熵增益最大原则迭代选取最优的多个人体特征;
获取受检者的所述多个人体特征中每个人体特征的值并进行组合,得到所述受检者的外界因素集。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,根据每个人体特征的值计算所述受检者罹患所述目标疾病的环境风险概率包括:
根据贝叶斯全概率公式计算所述受检者在所述外界因素集的情况下罹患所述目标疾病的环境风险概率。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,根据所述基因型风险概率和所述环境风险概率计算所述受检者罹患所述目标疾病的综合风险概率包括:
确定基因影响参数值和环境影响参数值,其中,所述基因影响参数值用于表示所述基因型风险概率对所述综合风险概率的影响,所述环境影响参数值用于表示所述环境风险概率对所述综合风险概率的影响;
将所述基因影响参数值和所述基因型风险概率、所述环境影响参数值和所述环境风险概率输入加权公式,得到所述综合风险概率。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,在得到所述综合风险概率之后,所述方法还包括:
通过优势比公式根据所述综合风险概率计算所述受检者的综合风险比。
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