[发明专利]肺癌组织lncRNA荧光原位杂交检测方法在审
申请号: | 201710659278.3 | 申请日: | 2017-08-04 |
公开(公告)号: | CN107478625A | 公开(公告)日: | 2017-12-15 |
发明(设计)人: | 王帅;王群;蒋伟;时雨;杨晓冬;詹成;蒋家好;刘红;汪灏;姚光宇 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属中山医院 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64 |
代理公司: | 上海卓阳知识产权代理事务所(普通合伙)31262 | 代理人: | 周春洪 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺癌 组织 lncrna 荧光 原位杂交 检测 方法 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及一种肺癌组织lncRNA荧光原位杂交检测方法。
背景技术
肺癌是我国最常见的恶性肿瘤。研究表明lncRNA参与人体恶性肿瘤的发生、发展。LncRNA在肺癌中的作用是医学研究的热点也是难点。如何检测目标lncRNA在肺癌组织的表达是学者们面临的首要问题。
肺癌组织内lncRNA的定量分析常用方法是RT-PCR;核质分离RT-PCR用于lncRNA定位分析。但是这些实验步骤繁琐,操作复杂。更重要的是提取肺癌组织RNA,常包含肿瘤间质细胞的RNA,不能完全反应肿瘤实质细胞中lncRNA的表达情况。
原位杂交检测具有重大技术优势。目前肺癌肿瘤细胞系内lncRNA的原位检测技术比较成熟,但是肺癌组织中lncRNA的荧光原位杂交技术一直不成熟。肺癌病理类型复杂,组织异型性明显。敏感性较差的原位杂交技术检测不出lncRNA的表达。肺癌间质内探针残留过多,背景染色较差,实质染色与间质残留区分不明显。因此,肺癌组织lncRNA荧光原位杂交检测技术有待进一步改进优化。
中国专利201611041669.0,公开日2017年01月25日公开了一种食管鳞癌组织中lncRNA的荧光原位杂交检测方法,包括:制备冰冻食管鳞癌组织切片,进行固定、消化与通透,采用lncRNA探针进行检测,进行DNA染色,封片,采用共聚焦显微镜检测成像或荧光显微镜检测成像。然而肺癌组织与食管鳞癌组织有很大不同,食管鳞癌以实性组织为主,肺癌组织内常残留含气的空腔及阻塞性肺气肿,且周围被肺泡组织包绕。因此有必要针对肺癌组织的特异性,进一步优化实验条件,改进实验步骤,设计肺癌组织lncRNA荧光原位杂交检测方法。然而现有技术中,关于本发明的肺癌组织lncRNA荧光原位杂交检测方法,目前还未见报道。
发明内容
本发明的第一个目的是针对现有技术中的不足,提供一种肺癌组织lncRNA荧光原位杂交检测方法,用于肺癌组织内lncRNA的表达水平及亚细胞定位分析。
为实现上述目的,本发明采取的技术方案是:
一种肺癌组织lncRNA的荧光原位杂交检测方法,包括:制备冰冻肺癌组织切片,组织固定、消化与通透,lncRNA探针杂交检测,DNA染色,封片,荧光检测成像。
进一步地,所述的lncRNA探针采用Cy3标记。
进一步地,所述的肺癌组织lncRNA的荧光原位杂交检测方法还包括:根据lncRNA成像位置,判断lncRNA是定位于细胞核还是细胞质,还是核质均匀表达。
进一步地,所述的肺癌组织lncRNA的荧光原位杂交检测方法还包括:根据肺癌组织中lncRNA成像的荧光光密度,计算lncRNA在肺癌组织中的相对表达量。
进一步地,所述的采用lncRNA探针进行检测的方法包括如下步骤:
(1)肺癌组织切片中加入预杂交液,37℃封闭40min;
(2)在避光条件下,将lncRNA探针加入到37℃的杂交液中,得到lncRNA探针杂交液;
(3)弃去组织切片中的预杂交液,加入lncRNA探针杂交液,室温杂交过夜,避光条件下清洗组织。
进一步地,所述的DNA染色采用DAPI进行复染。
进一步地,所述步骤1中的预杂交液由Blocking Solution与Pre-hybridization Buffer按照1:99比例混合制成。
进一步地,所述步骤2中的杂交液由Blocking Solution与Hybridization Buffer按照1:99比例混合制成。
本发明根据ATCG互补法则,特异性探针与lncRNA互补结合,检测lncRNA在肺癌组织的表达水平。DAPI与双链DNA结合,为常用的细胞核荧光染料。在荧光激发下,Cy3标记的探针显红色;DAPI显蓝色;颜色对比明显,互不干扰。根据目标lncRNA的荧光光密度,计算lncRNA在肺癌组织内的表达量。通过检测目标lncRNA的成像位置,判断目标lncRNA在肺癌组织中是细胞核表达还是细胞质表达。
与现有技术相比,本发明的有益效果是:
1、本发明的肺癌组织lncRNA荧光原位杂交技术,可以快速、准确地检测lncRNA的表达情况,为研究lncRNA在肺癌中的作用奠定基础。
2、本发明对荧光原位杂交图像进行高质量成像,直观检测lncRNA的表达,并原位展示lncRNA的亚细胞定位。
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