[发明专利]肽库

说明书

本申请是申请号为201080035488.1，申请日为2010年8月12日，发明名称 为“肽库”的中国专利申请的分案申请。

技术领域

本发明涉及肽，所述肽的结构通过结合至提供结构主链的化合物而受限，从 而赋予所述肽构象。特别地，本发明涉及通过改变肽和结构主链之间的相互作用 而改变这种肽库的构象多样性。

背景技术

不同的研究组已在先将具有半胱氨酸残基的多肽与合成分子结构连结(Kemp, D.S.和McNamara,P.E.,J.Org.Chem,1985；Timmerman,P.等人,ChemBioChem, 2005)。Meloen和同事已使用三(溴甲基)苯和相关分子以在合成骨架上快速定量 地环化多个肽环从而结构模拟蛋白质表面(Timmerman,P.等人,ChemBioChem, 2005)。用于产生候选药物化合物的方法(其中所述化合物通过将含半胱氨酸的 多肽连接至例如三(溴甲基)苯的分子骨架而产生)公开于WO 2004/077062和WO 2006/078161中。

WO2004/077062公开了一种选择候选药物化合物的方法。特别地，该文献公 开了包含第一和第二反应基团的各种骨架分子，并将所述骨架与另外的分子接触 以在偶联反应中在所述骨架和另外的分子之间形成至少两个连接。

WO2006/078161公开了结合化合物、免疫原化合物和拟肽类。该文献公开了 取自现有蛋白质的各种肽集合的人工合成。然后将这些肽与具有一些引入的氨基 酸变化的恒定合成肽组合以制备组合库。通过经由化学连接至具有各种氨基酸变 化的单独的肽而引入该多样性，提供了增加的机会来发现所需的结合活性。该文 献的图7显示了合成各种环肽构造的示意性代表。在该文献中公开的构造依赖于 -SH官能化的肽，其通常在骨架上包含半胱氨酸残基和芳香杂环基团，所述骨架通 常包含苄基卤取代基，如双-或三-溴苯基苯。这种基团反应以在肽和骨架之间形 成硫醚连接。

在本申请人的共同待审的未公布的国际专利申请PCT/GB2009/000301中，本 申请人公开了使用生物选择技术(如噬菌体展示)以选择连结至合成分子结构的 肽。

发明内容

骨架和多肽之间的相互作用的性质对于决定肽-骨架缀合物的结构形式是重要 的。尽管现有技术利用骨架来将结构赋予多肽，并因此允许通过改变肽序列而引 入构象多样性，但现有技术并未认识到结构以及结构多样性可通过操纵肽和骨架 之间的相互作用，以及改变骨架本身而得以改变。

本发明提供了利用骨架和骨架-肽界面而改变结构和/或引入结构多样性。

因此，在第一方面，本发明提供了一种改变第一多肽配体或第一组多肽配体 的构象以制备第二多肽配体或第二组多肽配体的方法，每个多肽配体包含由共价 连接至分子骨架的环序列分隔的至少两个反应基团，所述分子骨架与所述反应基 团形成共价键，所述方法包括自多肽和所述第一配体或第一组配体的骨架组装所 述第二配体或第二组配体，加上如下步骤之一：

a)：改变至少一个反应基团；或

b)：改变所述分子骨架的性质；或

c)：改变至少一个反应基团和所述分子骨架之间的键；或

d)：(a)、(b)或(c)的任意组合。

本发明所采用的方法允许本领域技术人员改变包含共价连接至分子骨架的多 肽的任意结构化多肽的构象，以及这种肽的基团。改变结构化多肽的构象将影响 其功能。例如，当结构化多肽为结合分子时，可改变结合特异性和/或结合亲合力。 结合亲合力可增大或减小。亲合力的增大可具有优点，例如允许使用较小量的治 疗剂或诊断剂。同样，可优选具有减小亲合力的化合物，例如以减少来自低水平 的靶蛋白(T-细胞受体配体等)的背景。

反应基团的改变通常包括用于与骨架形成共价键的氨基酸侧链中的变化。例 如，反应性胺或硫醇基团可被取代。这可通过氨基酸置换发生，例如半胱氨酸由 另一天然氨基酸(如赖氨酸)置换；由替代氨基酸(如硒代半胱氨酸或叠氮苯丙 氨酸)置换；以及例如通过改变相邻氨基酸之一或两者来改变反应基团位于多肽 中的环境，由此影响肽结构。