[发明专利]经由曲线减法检测基于质谱的相似性

说明书

本发明涉及经由曲线减法检测基于质谱的相似性。系统及方法分组已知化合物的两种或更多种产物离子的XIC峰值。在多个保留时间获得整个质量范围的产物离子光谱集合。选择所述已知化合物的M种产物离子。针对所述M种产物离子中的每一者计算XIC。将所述M个XIC中的每一XIC从其它M个XIC中的每一者减去。识别一或多个保留时间的一或多个区域，其中一或多个减法曲线具有在零的阈值内的值。针对所述一或多个区域中的每一区域，获得用以计算识别所述区域的所述一或多个减法曲线的两个或更多个XIC，并将所述区域中的所述两个或更多个XIC的每一峰值添加到峰值群组。

相关申请案的交叉参考

本申请案主张2015年2月5日申请的序列号为62/112,212的美国临时专利申请案的权益，所述临时专利申请案的全部内容以引用的方式并入本文中。

技术领域

本发明大体上涉及质谱，且更特定来说涉及经由曲线减法检测基于质谱的相似性。

背景技术

质谱仪通常与色谱或其它分离系统耦合，以便识别及特征化来自样本的所关注的洗脱已知化合物。在此耦合系统中，离子化洗脱溶剂，并以规定的时间间隔从洗脱溶剂获得一系列质谱。这些时间间隔从例如1秒到100分钟或更长。所述一系列质谱图形成色谱或提取离子色谱(XIC)。

在XIC中发现的峰值用于识别或特征化样本中的已知化合物。然而，在复杂混合物中，具有相同质荷比(m/z)的其它峰值的干扰可能使得难以确定表示已知化合物的峰值。在某些情况下，没有关于已知化合物的预期保留时间的信息。在其它情况下，可能知晓已知化合物的近似保留时间。然而，即使在后一种情况下，如果样本是复杂的，或如果样本之间存在不止是少量的保留时间变化，那么已知化合物的确切峰值可能是不明确的。因此，在这些情况下，通常难以识别或特征化已知化合物。

在传统的分离耦合质谱系统中，选择已知化合物的碎片或产物离子进行分析。然后在针对包含产物离子的质量范围的分离的每一间隔执行质谱/质谱(MS/MS)扫描。举例来说，随着时间推移，收集在每一MS/MS扫描中发现的产物离子的强度，并将其作为光谱集合或XIC来分析。

举例来说，对于简单的样本混合物，通常在已知化合物的预期保留时间在XIC中发现代表产物离子的单峰值。然而，对于更复杂的混合物，除了已知化合物的预期保留时间之外，代表产物离子的两个或更多个峰值位于光谱集合中的一或多个额外时间间隔处。换句话说，针对产物离子的XIC可具有两个或更多个峰值。

在更复杂的混合物中识别所关注的化合物的一种传统方法是对已知化合物的两种或更多种产物离子在其处具有峰值的时间间隔进行定位。举例来说，此方法在已知序列的肽被定量时用于蛋白质组学。

在典型的多反应监测(MRM)方法中，监测两个或更多个MRM转换，每一者对应于肽的不同产物离子转换。如果先前的发现数据可用，那么这些转换基于数据中观察到的最大产物离子。否则，举例来说，这些转换基于预测的y离子。针对这两个或更多个MRM转换来分析XIC。对于所有转换，在其间都存在产物离子峰值的时间用于特征化已知化合物。

对于复杂样本，特别是如果未准确知道预期的保留时间，那么产物离子谱的收集可能存在模糊性。举例来说，可存在多于一个的保留时间或时间间隔，两个或更多个MRM转换中的每一者在其间存在产物离子峰值。

几乎没有额外信息可用于解决复杂样本引入的模糊性。在传统的分离耦合质谱系统中，通常使用窄的前体离子质量窗口宽度来执行在每一时间间隔的每一产物离子的每一MS/MS扫描。因此，在数据采集后可用的针对每一碎片离子的特定时间间隔的产物离子质谱几乎不能提供额外的理解。