[发明专利]一种高通量测序碱基荧光识别系统装置与方法有效

专利信息
申请号: 201611207261.6 申请日: 2016-12-23
公开(公告)号: CN106770114B 公开(公告)日: 2018-03-13
发明(设计)人: 韩九强;戴怡轩;刘瑞玲 申请(专利权)人: 西安交通大学
主分类号: G01N21/64 分类号: G01N21/64;G01N33/52;C12M1/34
代理公司: 西安智大知识产权代理事务所61215 代理人: 段俊涛
地址: 710049 陕*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 一种 通量 碱基 荧光 识别 系统 装置 方法
【权利要求书】:

1.一种高通量测序碱基荧光识别装置,基因芯片放置于基因测序仪反应室内,其特征在于,包括:

位移控制模块(100),通过步进电机驱动精密导轨移动反应室,以控制基因芯片的扫描进程;

反应室恒温模块(200),利用温控系统(208)控制反应室的温度变化,温控系统(208)包括制热和制冷装置;

激光触发模块(300),包括主要激发碱基A和碱基C上荧光基团的红色激光器(302)和主要激发碱基G和碱基T上荧光基团的绿色激光器(301),红绿激光经过直角棱镜(401),形成一道激光,打在基因芯片上,结合有不同dNTP的荧光基团在激光的照射下,发出不同光谱特性的四种荧光;

荧光成像模块(400),利用sCMOS相机实现荧光图像成像,最后将图像传输到计算机进行测序碱基荧光识别;

其中:

所述基因测序仪反应室为相对密闭带卡扣的抽屉形式,包括反应室主体(203),反应室主体(203)上设置抽壳件(204)、X向插片(201)和Y向插片(202),X向插片(201)和Y向插片(202)堆叠在反应室主体(203)的上表面,X向插片(201)和Y向插片(202)上各开有一条开口,两条开口相互垂直,反应室主体(203)的顶部设置物镜固定夹(205),反应室主体(203)内置载物台(207)、流动槽(206)以及温控系统(208),其中,流动槽(206)设置在载物台(207)上,反应室主体(203)的侧面分别开有小孔,供硅胶软管插入,由注射针将软管里的试剂导入流动槽(206),温控单元(208)放置在载物台(207)正下方,对温度进行闭环控制;

所述激光触发模块(300)中:

绿色激光器(301)的输出光依次经滤光片一(303)、准直透镜一(305)、孔径光阑一(307),由反射镜一(309)反射到达半透半反镜(311);

红色激光器(302)的输出光依次经滤光片二(304)、准直透镜二(306)、孔径光阑二(308),由反射镜二(310)反射到达半透半反镜(311);

两束光再一同被反射镜三(312)反射到反射镜四(313),由反射镜四(313)将光束反射到透镜(314),再经由直角棱镜(401),将光束反射到滤波轮(402),经由镜筒(403)和物镜(404),到达基因芯片的上表面,激发携带有荧光基团的碱基发光。

2.根据权利要求1所述高通量测序碱基荧光识别装置,其特征在于,

所述位移控制模块(100)中,利用X-Y导轨装置带动反应室运动;

所述反应室恒温模块(200)中,利用温度传感器采集温度,加热装置为位于载物台下方的电热片,制冷装置为带散热风扇的半导体制冷片;反应室与试剂组和试剂泵连接,其中试剂泵连接电机,控制器也与电机连接,控制试剂泵向基因芯片完成注入工作。

3.根据权利要求1所述高通量测序碱基荧光识别装置,其特征在于,所述滤光片一(303)、半透半反镜(311)和滤光片二(304)均装在转轮上,扫描过程中,不断切换转轮,并通过滤波轮(402)实现扫描过程中的自动切换,形成四种光路。

4.根据权利要求1所述高通量测序碱基荧光识别装置,其特征在于,所述sCMOS相机作为光电转换器件,通过配备滤光片的镜头捕获基因芯片上某一特定区域(Δx×Δy)受激后发出的荧光,所述位移控制模块带动被扫描芯片运动,以完整扫描整个基因芯片。

5.基于权利要求1所述高通量测序碱基荧光识别装置的高通量测序碱基荧光识别方法,其特征在于,包括如下步骤:

步骤1,在基因芯片中注入四种不同类型的荧光染料,放置于基因测序仪反应室中;

步骤2,调节反应室恒温模块(200),使环境温度控制在基因生存所需的适宜范围内;

步骤3,控制激光触发模块(300)产生特定波长的平行线型激光束,激发待测基因芯片中核苷酸携带的荧光染料基团发光;

步骤4,利用位移控制模块(100)控制反应室移动,使激光束以速度可控的方式对基因芯片进行线扫描;

步骤5,利用sCMOS相机对视野中基因芯片发光碱基进行成像;

步骤6,将成像图像传输到计算机进行测序碱基荧光识别。

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