[发明专利]一种生物信息工程师技能评级系统在审
申请号: | 201611168415.5 | 申请日: | 2016-12-16 |
公开(公告)号: | CN106651167A | 公开(公告)日: | 2017-05-10 |
发明(设计)人: | 李山;胡涛;翟洋;李良波;白丽军;杨斌 | 申请(专利权)人: | 成都生命基线科技有限公司 |
主分类号: | G06Q10/06 | 分类号: | G06Q10/06;G06F17/30 |
代理公司: | 成都行之专利代理事务所(普通合伙)51220 | 代理人: | 郭受刚 |
地址: | 610000 四川省成都市高新区天*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 生物 信息 工程师 技能 评级 系统 | ||
技术领域
本发明涉及计算机生物信息领域,具体地,涉及一种生物信息工程师技能评级系统。
背景技术
生物信息学是生命科学和计算机科学相结合的一门新学科,是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的学科。当前从事生物信息分析的工程师,涉及到的技能包括生物学、计算机、数学、物理、信息科学等多个学科,工程师在进行生物学研究时,实验下游的数据分析部分需要借助计算机编程、数学统计、现有软件等手段来得到实验结论。生物信息工程师需要进行分析思路的设计、实现等,数据大多来源于DNA测序仪,以及其他设备。
目前,平台或者用户都急需对生物信息工程师进行合理的评级,以便满足各方的需求,而不同的生物信息工程师由于自身原因具有不同的工作能力,而现有技术中没有对生物信息工程师评级的合理方法和系统,倚靠人工进行评级效率较低,且由于数据资源有限,评级的准确性和可靠性较差,参考价值较低。没有一个成熟、准确、专门针对生物信息分析工程师的技能评级方法。
综上所述,本申请发明人在实现本申请发明技术方案的过程中,发现上述技术至少存在如下技术问题:
在现有技术中,现有的生物信息分析工程师的技能评级方法存在效率、准确率和可靠性较差的技术问题。
发明内容
本发明提供了一种生物信息工程师技能评级系统,解决了现有的生物信息分析工程师的技能评级方法存在效率、准确率和可靠性较差的技术问题,实现了系统设计合理,准确、高效、可靠的对生物信息工程师技能进行评级的技术效果。
为解决上述技术问题,本申请提供了一种生物信息工程师技能评级系统,所述系统包括:
生物信息分析类型数据库,生物信息分析类型数据库中包括:生物信息分析类型数据以及每种生物信息分析类型的难度系数数据;
生物信息期刊数据库,生物信息期刊数据库中包括:期刊的基本信息、每年各期刊的影响因子、每年各期刊的特征因子;
收集单元,所述收集单元用于收集生物信息工程师的基本信息和用户项目评价登记信息;
建立单元,所述建立单元用于将收集单元收集的信息作为训练样本,基于生物信息分析类型数据库和生物信息期刊数据库建立分类器;
评级单元,所述评级单元用于基于建立的分类器,对生物信息工程师技能进行评级。
进一步的,所述生物信息分析类型数据库的建立具体包括:
首先,分别建立DNA、RNA、环境微生物、蛋白质组学、代谢组学、基因6大类数据库,并建立小类生物信息分析类型数据库(如DNA大类下包括动植物de novo测序、微生物de novo测序、人全基因组重测序、动植物全基因组重测序、目标区域测序、全外显子组测序、ChIP-seq、简化基因组-RAD等),标记每种分析类型的分析方法、分析内容、模板信息;
然后,对于不同种类的分析类型,收集该类型相关项目作为样本,根据行业经验对样本进行评估,获得每种生物信息分析类型的难度系数;
然后,统计出每种分析类型的难度系数。
其中,通过对生物信息分析类型进行合理的划分,能够建立准确全面的生物信息分析类型数据库,进而能够准确的将生物信息工程师对应到相应的学科和领域,划分更加细致准确,对生物信息工程师的评级更加准确。
进一步的,所述生物信息期刊数据库的建立具体为:收集SCI、JCR信息,建立生物信息期刊数据库。
其中,美国《科学引文索引》(Science Citation Index,简称SCI)于1957年由美国科学信息研究所(Institute for Scientific Information,简称ISI)在美国费城创办,是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库,是国际公认的进行科学统计与科学评价的主要检索工具,ISI每年出版JCR(《期刊引用报告》,全称Journal Citation Reports)。JCR对包括SCI收录的3800种核心期刊(光盘版)在内的8000多种期刊(网络版)之间的引用和被引用数据进行统计、运算,并针对每种期刊定义了影响因子(Impact Factor)等指数加以报道。通过收集SCI、JCR信息,可以建立数据全面准确的生物信息期刊数据库,而利用数据全面准确的生物信息期刊数据库可以对生物信息工程师的论文期刊发表情况进行评价,进而对生物信息工程师的技能评级提供准确的参考因素。
进一步的,所述基于生物信息分析类型数据库和生物信息期刊数据库建立分类器,具体包括:
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