[发明专利]解构实验数据中的重叠峰

权利要求书

1.一种从生物样本的其他部分的其他峰信号当中识别与所述生物样本的第一部分相对应的第一峰信号的方法，所述生物样本包括含有核酸并且对应于所述生物样本的不同部分的多个微滴，所述方法包括：在计算机系统处，

接收来自涉及所述生物样本的微滴数字聚合酶链式反应(ddPCR)实验的数据信号，所述数据信号具有随着时间变化的振幅，其中，所述数据信号包括在不同时间的多个重叠峰；

对所述数据信号进行变换，以获得与局部函数对应的系数的二维阵列，每一个系数对应于具有时间位置和尺度因子的局部函数；

识别与所述第一峰信号的第一峰相对应的第一时间区域；

移除所述二维阵列中与具有在所述第一时间区域内的时间位置的局部函数相对应的系数；

使用对所述其他峰信号的尾部进行建模的截断函数来确定所述二维阵列的新系数；

使用所述新系数来获得改变的二维阵列；

执行对所述改变的二维阵列的逆变换，以获得背景信号；

从所述数据信号中减去所述背景信号，以获得与所述生物样本的所述第一部分相对应的所述第一峰信号；以及

基于所述第一峰信号确定在所述生物样本的第一部分中存在或不存在核酸序列。

2.如权利要求1所述的方法，进一步包括通过以下方式来计算所述截断函数的参数：

从重叠预定峰信号的第一集合中创建人工数据信号；

针对所述重叠预定峰信号中的每一个，通过计算人工背景信号并且从所述人工数据信号中减去所述人工背景信号来计算恢复峰；

确定所述恢复峰与所述重叠预定峰信号之间的差异；以及

在回归分析中使用所述差异来确定所述截断函数的所述参数。

3.如权利要求2所述的方法，其中，对所述参数进行更新，以确定新的恢复峰和新的差异，并且其中，所述回归分析使所述差异最小化。

4.如权利要求2所述的方法，其中，所述差异包括以下各项中的至少一项：高度失配、宽度失配、位置失配、以及恢复峰的负值。

5.如权利要求2所述的方法，其中，所述重叠预定峰信号的第一集合具有第一宽度，并且使用所述重叠预定峰信号的第一集合来确定参数的第一集合，所述方法进一步包括：

使用重叠预定峰信号的第二集合来确定参数的第二集合，所述重叠预定峰信号的第二集合具有不同于所述第一宽度的第二宽度；

对所述参数的第一集合和所述参数的第二集合求平均，以为所述参数获得种子值；

在下一次回归迭代中使用所述种子值来确定参数的新集合，对所述参数的新集合求平均，以为所述参数确定新种子；以及

重复对种子值的计算，直到所述参数的第一集合和所述参数的第二集合收敛于彼此为止。

6.如权利要求1所述的方法，其中，所述截断函数被定义为：

其中，A、B、C和D是回归参数，i对应于所述二维阵列中的所述尺度因子的尺度指数，j对应于所述二维阵列中的所述时间位置的时间指数，最小值是所述二维阵列中的最小值，尺度宽度是由所述二维阵列所覆盖的所述尺度因子的宽度，时间宽度是所述第一时间区域的宽度，尺度中心是所述尺度因子的宽度的中心，并且时间中心是所述第一时间区域的中心。

7.如权利要求1所述的方法，其中，对所述数据信号进行变换以获得所述二维阵列的特定系数包括：

计算所述数据信号的卷积以及以时间t为中心并具有尺度因子a的特定局部函数。

8.如权利要求7所述的方法，其中，计算所述卷积包括：

计算所述数据信号的第一离散变换，以获得数据点的第一集合；

计算所述特定局部函数的第二离散变换，以获得数据点的第二集合；以及

将所述第一集合的数据点乘以所述第二集合的相应数据点并进行求和，以获得所述卷积的结果。

9.如权利要求8所述的方法，其中，所述第一离散变换和所述第二离散变换是傅里叶变换。