[发明专利]一种动物选配方法

说明书

技术领域

本发明涉及动物配种领域，尤其涉及一种动物选配方法。

背景技术

动物品种的优化是维持生物多样性和生态平衡的重要基础，亦可为将来动物育种提供素材，储备将来所需的特定性状的遗传基因。从遗传学角度考虑，动物品种的优化就是对动物基因的优化。因为基因是遗传变异的基本功能单位，任何性状都是由基因决定的，所以品种的灭绝其实就是基因的丧失。现行的动物品种保护方式大部分为活体保种，而且是小群体活体保种，其受到自然选择压是不可避免的，所以要求活体保种的群体大，防止近交，否则容易引起遗传漂变，基因丢失，近交系数增加，导致近交衰退，甚至群体退化或灭绝；因此在一定的群体规模的基础上，如何控制近交系数就显得尤为重要。

在一个闭锁繁育的群体中，近交系数的增加是不可避免的，控制和降低群体平均近交系数主要通过选配来完成；现行的通用做法为：随机交配，在保种群中避免全同胞、半同胞选配，或采用非近交公畜轮回配种。但即使采用上述的现行通用做法，还是不能准确预测下一世代群体平均近交系数增量，以及若干世代后群体的平均近交系数，也就不能指导保种实践，究竟何时引入外血，所以必须要建立一个切实可行的动物选配方案，对动物保种群实行持续的遗传监测，及时发现保种实践中的偏差，为及时采取改进措施和不断提高保种效果提供依据。

本发明创造主要解决的技术问题有：根据不同的选配方案，准确预测下一世代群体平均近交系数；根据现行群体规模、结构和近交系数，依据现行通用的留种方式，即各家系等量留种，每一世代留种时，每一公畜后代中选留一头公畜，每一头母畜后代中选留等数母畜，采用0-1整数规划方法，确定最优的选配方案，即确定每一头公畜的与配母畜，每一头母畜的与配公畜，从而将下一世代群体平均近交系数控制在最低水平；下一世代群体留种确定后，采用上述方法，制订下一世代群体选配方法，预测下一世代群体平均近交系数，以此类推，可以预测若干世代后闭锁繁育群体平均近交系数。

发明内容

发明目的：为了克服现有技术中存在的不足，本发明提供一种动物选配方法，降低群体的平均近交系数，实现品种的优化。

技术方案：为实现上述目的，本发明的动物选配方法，包括以下步骤：

(1)根据畜群谱系建立群体加性遗传相关矩阵，所述矩阵的元素为对应行或列畜类的近交系数；

(2)按照设定的种母畜个数k和种公畜个数n，根据所述加性遗传相关矩阵建立子代近交系数矩阵；

(3)根据所述种母畜个数和所述种公畜个数建立配对矩阵；

(4)根据所述子代近交系数矩阵和所述配对矩阵，以配对组合的子代近交系数F最小作为优化目标，从母畜遗传的角度建立约束条件，得到第一线性规划方程并进行求解得到最优的公母畜配对组合和子代种母畜。

进一步地，根据所述子代近交系数矩阵和所述配对矩阵，以配对组合的子代近交系数F最小作为优化目标，从公畜遗传的角度建立约束条件，得到第二线性规划方程并进行求解得到子代种公畜。

其中，步骤(4)中所述第一线性规划方程为：

目标函数：F=Σi=1kΣj=1nFijAij]]>

约束条件：