[发明专利]一种从鱼类历史标本中提取DNA的方法在审
申请号: | 201510568890.0 | 申请日: | 2015-09-09 |
公开(公告)号: | CN105063019A | 公开(公告)日: | 2015-11-18 |
发明(设计)人: | 陈善元;肖蘅;李春青 | 申请(专利权)人: | 云南大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 昆明科阳知识产权代理事务所 53111 | 代理人: | 董建国 |
地址: | 650091*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鱼类 历史 标本 提取 dna 方法 | ||
技术领域
本发明属于分子生物学领域,具体涉及从鱼类历史标本中提取DNA的方法。
背景技术
我国地形地貌复杂,湖泊众多,分布在我国的鱼类资源十分丰富,但因环境变化及人为影响,很多鱼类物种资源在我们人类还没来得及认识就消失了,只剩下早期留下的浸泡标本,成为证明它们存在的唯一线索。分子生物学技术发展为探索这些鱼类物种资源提供了新的途径,获取DNA是开展分子生物学研究的第一步,但从经过长时间浸泡的标本中提取DNA也成了研究这些鱼类的首道屏障。
经过长时间浸泡后,不仅细胞结构发生了变化,细胞内的大分子物质已经降解或者正在降解,为了得到相对完整的DNA序列,人们在DNA析出和纯化过程中花费了大量的精力和时间,却忽略了材料的预处理步骤,大多只是进行简单的清洗就进入了破碎环节。
发明内容
为解决上述问题,在对酒精浸泡的历史标本进行DNA提取时,加入预处理环节,主要包括以下6个步骤:
(1)将组织材料放于70%的酒精中浸泡20分钟以上;
(2)将组织材料转于50%的酒精中浸泡15分钟以上;
(3)将组织材料转于30%的酒精中浸泡10分钟以上;
(4)将组织材料转于10%的酒精中浸泡10分钟以上;
(5)将组织材料转于无菌水中浸泡10分钟以上;
(6)将组织材料转于TE缓冲液(10mMTris-HCl和1mMEDTA,pH8.0)中浸泡10分钟以上;
以上各步骤中,液体的体积至少是所处理材料体积的10倍以上。
进一步,步骤(1)的浸泡时间为40-60分钟。
进一步,步骤(2)的浸泡时间为30-40分钟。
进一步,步骤(1)的浸泡时间为40分钟,步骤(2)的浸泡时间为40分钟,步骤(3)-(6)的浸泡时间为10分钟。
经研究发现,将酒精中的标本进行预处理,用酒精水溶液逐步置换出标本组织中的酒精,再将标本组织转移至TE缓冲液中,还原至近似体液中的细胞后再进入破碎环节,能提高DNA的产量和质量。
经过上述处理后,从酒精浸泡的历史标本中提取的DNA产量和质量都有很大的提高。
具体实施方式
下面通过实施例对本发明做进一步说明。
取酒精浸泡60年的鲤科鱼类标本2克,进入下列处理程序:
(1)将组织材料放于50毫升70%的酒精中浸泡40分钟;
(2)将组织材料转于50毫升50%的酒精中浸泡40分钟;
(3)将组织材料转于50毫升30%的酒精中浸泡10分钟;
(4)将组织材料转于50毫升10%的酒精中浸泡10分钟;
(5)将组织材料转于50毫升无菌水中浸泡10分钟;
(6)将组织材料转于50毫升TE溶液(10mMTris-HCl和1mMEDTA,pH8.0)中浸泡10分钟;
组织材料预处理后进入破碎和DNA提取的其它环节,最后得到了50ngDNA,平均长度达到4kb,与对照相比,产量提高了100%,长度增加了300%。
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