[发明专利]甘蓝型油菜控制开花相关的BnGI基因序列无效
申请号: | 201410100829.9 | 申请日: | 2014-03-18 |
公开(公告)号: | CN103923929A | 公开(公告)日: | 2014-07-16 |
发明(设计)人: | 刘杨;周晓晨;韩洪强;刘畅;赵越 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12N15/10;A01H5/00 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 牛山;陈少凌 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甘蓝 油菜 控制 开花 相关 bngi 基因 序列 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域的基因序列,具体涉及一种甘蓝型油菜控制开花相关的BnGI基因序列。
背景技术
植物从营养生长过渡到生殖生长所经历的生理变化是内源和外源信号响应的的结果,这些信号作用导致植物的开花。开花是植物由营养生长到生殖生长的转折点,开花时间与作物收获时间、产量及种植适应性有重要的关联。调控植物开花的基因研究从不同调控途径展开以模式植物拟南芥为基础进行已经取得了较多的成果。
GI(GIGANTEA)是重要的生物节律钟输出基因,在光周期和生物节律钟调节开花途径中有着重要的作用。GI位于开花促进基因CO、FT的上游,受昼夜节律的调控,上调下游开花促进基因,在光周期介导开花的过程中有一定的调节作用。首先在拟南芥中分离出GI基因,并证明其表达由生物节律钟调控,目前,在大豆、菊花、大麦、朵蝶兰等植物中GI基因已被克隆和报道。
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是十分重要的油料作物,是国产食用植物油的第一大来源,在我国食用油市场中具有举足轻重的地位。有关甘蓝型油菜开花相关基因的研究主要集中于FLC、FRI、CO、FT等少数几个基因上,而GI基因在甘蓝型油菜中未见有克隆的报道。
发明内容
本发明的目的在于提供一种甘蓝型油菜控制开花相关的BnGI基因序列。该基因cDNA全长4153bp,编码区全长为3516bp,编码1171个氨基酸。根据BnGI基因在甘蓝型油菜不同组织中的表达量分析初步探索了该基因的表达模式,为进一步研究该基因在调控开花中的作用机制打下基础。
本发明的目的是通过以下技术方案实现的:
第一方面,本发明涉及一种甘蓝型油菜控制开花相关的BnGI基因序列,该基因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
优选地,所述基因序列如SEQ ID NO.1第1~3516位所示。
第二方面,本发明涉及一种前述BnGI基因序列的克隆方法,所述方法包括如下步骤:
1)甘蓝型油菜组织总RNA的提取;
2)以白菜GI基因gi登录号328684600作为种子序列,本地检索甘蓝型油菜EST数据包,利用电子克隆的技术,将检索到的目标EST拼接组装成甘蓝型油菜的BnGI基因;根据该BnGI基因,设计能够扩增出全长的基因特异引物:
如SEQ ID NO.4所示的GI_F,
如SEQ ID NO.5所示的GI_R;
3)以甘蓝型油菜组织RNA反转录得到的甘蓝型油菜cDNA为模板,利用所述基因特异引物GI_F、GI_R克隆出BnGI基因的全长cDNA序列。
第三方面,本发明涉及一种前述甘蓝型油菜控制开花相关的BnGI基因序列在制备甘蓝型油菜品种中的用途,所述用途为采用基因工程手段或者基因干扰方法,调控所述基因序列的表达水平,进而引起甘蓝型油菜开花调控机制的变化,获得开花时间不同的甘蓝型油菜品种。
本发明根据NCBI数据库,运用生物信息学手段,通过同源序列比对设计出基因特异引物,用分子克隆的方法,克隆出甘蓝型油菜控制开花相关的BnGI基因;经过序列分析,确定是甘蓝型油菜BnGI基因;组织表达分析表明,BnGI在不同组织中均有表达,但表达量具有组织差异性。
本发明具有的有益效果为:在BnGI基因的研究上,还可以继续利用相关序列信息扩增出BnGI基因的全长DNA序列,利用转基因、基因干扰以及基因敲除等技术分析其对油菜开花早晚的影响。也可以研究BnGI基因在响应生物节律钟信号上的作用机制,同时结合育种技术获得适宜的早晚熟材料,为甘蓝型油菜的生产提供理论和实践的指导。
附图说明
通过阅读参照以下附图对非限制性实施例所作的详细描述,本发明的其它特征、目的和优点将会变得更明显:
图1为本发明BnGI基因cDNA全长扩增的凝胶电泳图;其中,a为BnGI基因的克隆,b为PCR鉴定大肠杆菌DH5α转化子;图中BnGI:BNGI基因cDNA全长;1-4:BnGI基因cDNA全长DH5α转化子的PCR产物;M:DL5000Maker;
图2为本发明BnGI基因在甘蓝型油菜植株不同组织中表达量示意图。
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