[发明专利]黄麻表达序列标签微卫星DNA标记

说明书

技术领域

 本发明涉及一种分子标记技术，具体涉及一种黄麻表达序列标签微卫星DNA分子标记。

背景技术

微卫星（又称为简单重复序列，SSR）是由1-6个核苷酸组成的短序列串联重复多次而组成的一段DNA；其中，最常见的是二核苷酸和三核苷酸重复单元，如(CT)n，(AT)n，(ACC)n、(CGA)n和(AGA)n。由于微卫星侧翼序列相对保守，根据其侧翼序列设计引物，可用PCR 扩增出微卫星位点的序列。由于微卫星中重复单元的重复次数不同，因而扩增出的微卫星序列的长度呈现多态性。微卫星序列广泛存在于真核生物基因组中，而且随机分布，具有多态性较高，重复性和稳定性好等特点，是十分有效的分子标记，被广泛应用于遗传图谱构建、基因定位、遗传关系分析、品种鉴定等领域。如用微卫星标记分析黄麻的起源演化关系 (Kundu 等，2013，Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology，22 ： 372-381)、用微卫星 DNA 标记进行猪品种分类的专利申请“适于猪品种分类的猪微卫星DNA标记”（公开号CN1370834A）。

黄麻是椴树科(Tiliaceae)黄麻属(Corchorus)一年生草本植物，是重要韧皮纤维作物。在世界上黄麻产量与种植面积仅次于棉花，主要在亚洲(印度、孟加拉、中国和泰国)和拉丁美洲种植。生产上栽培的有长果种(Corchorus olitorius L.)和圆果种(Corchorus capsularis L.)，染色体数均为2n=2X=14。黄麻纤维细软、强力大、吸湿性好、散水快，可纺性好，用途十分广阔。

至今在黄麻基因组中已找到的近1000个微卫星标记，与此同时，黄麻微卫星DNA在基因定位和遗传多样性分析中的应用也迅速铺开，有关黄麻微卫星标记的专利争夺正逐步展开。但是，我国黄麻微卫星的研究仍十分有限，仅极少数实验室开始了有关工作。鉴于黄麻微卫星数目多，还有大量的未被发现，且它们具有重要的理论和应用价值，特别是GenBank公共数据库中还可能存在大量的微卫星位点。因此，在我国开展黄麻的微卫星的分离、鉴定和应用研究，开发具有我国知识产权的微卫星标记显得十分迫切和必要。

发明内容

 本发明的目的在于：分离和鉴定黄麻表达序列标签微卫星DNA标记，建立黄麻微卫星DNA的技术体系并利用这些分子标记进行黄麻遗传多样性分析。

本发明实现的技术方案：

所述黄麻微卫星DNA标记编号CcSSR001-CcSSR045、CoSSR046-CoSSR066，所对应的黄麻微卫星DNA标记引物序列为SEQ ID NO.1-132所示。

所述黄麻微卫星DNA标记编号CcSSR001-CcSSR045为圆果种黄麻EST-SSR，CoSSR046-CoSSR066为长果种黄麻EST-SSR。