[发明专利]一种与玉米GPAT基因连锁的SNP位点及其应用有效
申请号: | 201210444681.1 | 申请日: | 2012-11-09 |
公开(公告)号: | CN102899324A | 公开(公告)日: | 2013-01-30 |
发明(设计)人: | 严建兵;杨小红;李建生;李慧 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;A01H1/04 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 430070 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 玉米 gpat 基因 连锁 snp 及其 应用 | ||
1.一种与玉米GPAT基因连锁的SNP位点,其特征在于,所述的SNP位点与玉米油份含量相关,与玉米甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因紧密连锁,位于玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)chr3.S_178136002上,该位点突变为G/C。
2.如权利要求所述的SNP位点的应用,包括以下步骤:
a)由473个普通玉米自交系和35个高油玉米自交系组成AM508群体;
b)从授粉15天后的AM508份自交系中随机选择368份自交系,构建200bp大小插入片段文库,采用90bp末端配对的RNA测序技术进行转录组测序;
c)利用3个群体进行连锁分析:高油玉米自交系By804与普通玉米自交系B73衍生的重组自交系,利用包含1536个SNP标记的GoldenGate芯片对家系及其亲本进行基因型鉴定,利用Mapmaker3.0软件构建连锁图,采用复合区间作图法进行QTL定位;
d)结合F2、F2:3两个世代群体油份含量的测定结果,利用软件QTL cartographer V2.5,采用复合区间作图法筛选与油份含量紧密连锁的QTL位点;筛选到在F2和F2:3两个世代均能稳定表达的油份含量主效QTL。
3.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的SNP位点在玉米育种的应用。
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