[发明专利]一种与玉米GPAT基因连锁的SNP位点及其应用有效

专利信息
申请号: 201210444681.1 申请日: 2012-11-09
公开(公告)号: CN102899324A 公开(公告)日: 2013-01-30
发明(设计)人: 严建兵;杨小红;李建生;李慧 申请(专利权)人: 华中农业大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68;A01H1/04
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 430070 *** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 玉米 gpat 基因 连锁 snp 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种与玉米GPAT基因连锁的SNP位点,其特征在于,所述的SNP位点与玉米油份含量相关,与玉米甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因紧密连锁,位于玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)chr3.S_178136002上,该位点突变为G/C。 

2.如权利要求所述的SNP位点的应用,包括以下步骤: 

a)由473个普通玉米自交系和35个高油玉米自交系组成AM508群体; 

b)从授粉15天后的AM508份自交系中随机选择368份自交系,构建200bp大小插入片段文库,采用90bp末端配对的RNA测序技术进行转录组测序; 

c)利用3个群体进行连锁分析:高油玉米自交系By804与普通玉米自交系B73衍生的重组自交系,利用包含1536个SNP标记的GoldenGate芯片对家系及其亲本进行基因型鉴定,利用Mapmaker3.0软件构建连锁图,采用复合区间作图法进行QTL定位; 

d)结合F2、F2:3两个世代群体油份含量的测定结果,利用软件QTL cartographer V2.5,采用复合区间作图法筛选与油份含量紧密连锁的QTL位点;筛选到在F2和F2:3两个世代均能稳定表达的油份含量主效QTL。

3.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的SNP位点在玉米育种的应用。 

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