[发明专利]一种干涉GDF9基因表达的 siRNA及其应用无效
申请号: | 201210438026.5 | 申请日: | 2012-11-06 |
公开(公告)号: | CN102965372A | 公开(公告)日: | 2013-03-13 |
发明(设计)人: | 习欠云;张永亮;施振旦;肖敏;蕉莉;石德顺;刘庆友 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/63;C12N15/867;A61K48/00;A61P43/00 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 干涉 gdf9 基因 表达 sirna 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学以及生物工程技术领域,具体涉及抑制水牛生长分化因子9(GDF9)基因表达的siRNA片段。
背景技术
RNAi(RNA interference),即RNA干扰,是真核生物中普遍存在的抵抗病毒入侵、抑制转座子活动、调控基因表达的监控机制。RNAi是通过双链RNA诱导与之同源的mRNA降解,导致目标基因转录后缄默的现象或机制。此现象于1998年在对线虫的研究中首次发现。siRNA是进入细胞内的外源dsRNA或内源产生的dsRNA,被Dicer酶切割成为2l-23nt长的小分子,这种siRNA是RNAi机制中的关键中间产物,具有非常强的RNAi效应。
RNAi途径中,RISC(RNA induced silencing complex)的形成发挥了极大的作用。RISC是由小分子RNA(siRNA/miRNA),Dicer,DadR蛋白和Argonaute家族蛋白组成的复合体,其作用是直接造成与复合体中siRNA高度互补的mRNA被降解。RISC作用过程中,mRNA的切割发生在对应的siRNA 5’端10~11位核苷酸间,切割将mRNA一分为二,切割后mRNA从RISC上释放。完成一次切割后,引导 siRNA仍然结合在RISC中,继续完成更多轮的切割。
生长分化因子9(growth differentiation factor 9 ,GDF9)主要在卵泡中表达,同时在非性腺组织中有表达,能促进始基卵泡的发育,与FSH协同刺激卵泡生长,主要调控卵泡的生长发育和生殖功能。GDF9基因敲除小鼠因初级卵泡发育受阻,从而影响生殖。而体外给予生物活性的GDF9可诱导窦前卵泡生长和细胞分泌。以上表明GDF9对卵泡的生长发育影响是有阶段依耐性。Hanrahan等(2004)发现GDF9的FecGH突变(G8突变)能显著提高杂合绵羊的排卵率。
siRNA作为一种新型的基因工具来抑制特定基因的表达,目前大规模应用于生物细胞、组织和个体,特别是用来制备基因敲低模式动物,从动物整体水平研究基因的功能,siRNA的抑制特定基因的优点是其他基因技术都无法比拟的。而对于水牛生长分化因子9的siRNA还未见研究报道。
发明内容
本发明的目的在于通过下调GDF9基因的部分功能来提高水牛的繁殖率,由于水牛繁殖率普遍较低,本发明提供了一种抑制水牛生长分化因子9(GDF9)基因表达的siRNA。
本发明通过以下技术方案实现上述目的:
一种抑制水牛生长分化因子9(GDF9)基因表达的siRNA,分别命名为GDF9-1、GDF9-2和GDF9-3,其核苷酸双链中正义链序列如下:
GDF9-1: SEQ ID NO:1;
GDF9-2: SEQ ID NO:2;
GDF9-3: SEQ ID NO:3。
所述siRNA与GDF9基因mRNA反向互补,其长度为19~27bp。
含有上述siRNA的shRNA。
上述shRNA的编码基因,两端带有BamHⅠ和EcoR I酶切位点的序列,便于构建表达质粒,双链核苷酸序列如下:
GDF9-1dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列;
GDF9-2dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列;
GDF9-3dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列。
一种表达载体,由上述shRNA的编码基因与出发载体构建的,即将shRNA编码基因插入出发载体上构建而成。
慢病毒载体可以直接高效率地感染分裂期和非分裂期细胞,且转染效果更加稳定,作为上述出发载体中的优选方案,其中病毒载体最优选pshRNA-copGFP Lentivector。该载体具有完整的shRNA插入位点以及绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)报告基因,实现了靶基因shRNA的高效表达、病毒包装以及转基因的直观展示。
本发明的siRNA可以制备成基因药物或其他合适的制剂用于下调水牛生长分化因子9的表达,从而提高水牛的繁殖性能。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
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